MolDrawの無料化学ツール完全ガイド
MolDrawの無料化学ツールすべて（変換ツール、計算ツール、描画ユーティリティ、教育用リソース）へのリンクを集めたディレクトリです。クイックリファレンスとして使うか、MolDrawの出典を明記して他のサイトで共有してください。
クイックガイド：MolDrawツールの使い方
MolDrawはブラウザで使える無料の化学プラットフォームです。ほとんどの作業でソフトのインストールは不要です。
- 構造式を描く・編集する — 2D描画、3D表示、SMILESのエクスポート、ダウンロードにはMolDrawエディターを開きます。
- すべてのツールを見る — 化学ツール一覧または無料化学ツールのディレクトリから始めます。
- 入力に合ったツールを選ぶ — SMILES、名前、分子式、XYZ座標、CAS番号、MOL/SDFブロックなど。
- 変換・計算する — ブラウザでツールを実行し、結果をコピーするかファイルをダウンロードします。
- エディターに戻る — 多くのツールには、構造式をさらに編集したいときのためにMolDrawへ戻るリンクがあります。
おすすめの対象：デスクトップソフトなしで手軽に化学ユーティリティを使いたい学生、教員、実験チーム、研究者。
MolDrawエディター描画、3D表示、各形式でのエクスポートエディターを開く →
化学ツール一覧すべてのツールカテゴリーを見る一覧を開く →
ツールディレクトリインデックス化されたツールのURLディレクトリを開く →
短めのツールガイドカテゴリー別の概要記事ガイドを読む →
描画・構造式ツール
| ツール | できること | リンク |
|---|---|---|
| MolDrawエディター | 2D描画、3D表示、名前検索、PNG/SVG/SDF/XYZ/PDBエクスポート | MolDrawエディターを開く |
| 化学反応式作成ツール | 反応物、生成物、矢印、試薬、条件を含む反応式を描く | 化学反応式作成ツールを開く |
| SMILESから構造式へ | SMILESを貼り付けて2D構造式を表示 | SMILESから構造式へを開く |
| 構造式からSMILESへ | 2Dエディターで描くとリアルタイムでSMILESを取得 | 構造式からSMILESへを開く |
| SMILESから3D構造へ | 3D表示とPNG、SDF、XYZ、PDB、MOL、OBJ、X3Dのダウンロード | SMILESから3D構造へを開く |
| XYZ / Gaussianから2Dへ | XYZ、.gjf、.comの座標を推定した2D構造式に変換 | XYZ / Gaussianから2Dへを開く |
| XYZ→SMILES | XYZ座標をSMILESに変換し、編集可能な形で整える | XYZ→SMILESを開く |
| 名前から構造式へ | 名前から2D構造式、SMILES、分子式、分子量、PubChem CIDを取得 | 名前から構造式へを開く |
| 分子式から構造へ | C9H8O4などの分子式を検索し、PubChemの候補を比較 | 分子式から構造へを開く |
| ルイス構造式ジェネレーター | 分子式と電荷からルイス構造式（電子点式）を作成 | ルイス構造式ジェネレーターを開く |
| タンパク質ビューア | PDB IDまたはファイルでタンパク質を読み込み、各形式でエクスポート | タンパク質ビューアを開く |
SMILES、MOL、SDF、PDBなどのファイル変換ツール
| ツール | できること | リンク |
|---|---|---|
| SMILESからMOLへ | エディターやELNのワークフロー向けにSMILESをMOLに変換 | SMILESからMOLへを開く |
| SMILESからSDFへ | データセット用にSMILESからSDFを生成 | SMILESからSDFへを開く |
| SMILESからMOL2へ | ドッキングの準備用にSMILESをMOL2に変換 | SMILESからMOL2へを開く |
| SMILESからPDBへ | SMILESをダウンロード可能な3D PDBに変換 | SMILESからPDBへを開く |
| SMILESからPDBQTへ | ドッキング用にSMILESをPDBQTに変換 | SMILESからPDBQTへを開く |
| MOLからSMILESへ | MOL/SDFブロックをSMILESに変換 | MOLからSMILESへを開く |
| MOL2からSMILESへ | MOL2のリガンドブロックをSMILESに変換 | MOL2からSMILESへを開く |
| PDBからSMILESへ | リガンドのPDBテキストをSMILESに変換 | PDBからSMILESへを開く |
| PDB→PDBQT | PDB座標をPDBQTに変換 | PDB→PDBQTを開く |
| SDFからInChIへ | SDF/MOLブロックをInChIに変換 | SDFからInChIへを開く |
| SDFからInChIKeyへ | SDF/MOLブロックからInChIKeyを生成 | SDFからInChIKeyへを開く |
| MOLからInChIへ | MOL/SDFをInChIに変換 | MOLからInChIへを開く |
| MOLからInChIKeyへ | MOL/SDFをInChIKeyに変換 | MOLからInChIKeyへを開く |
InChI、InChIKey、IUPAC名、CID、CASのツール
| ツール | できること | リンク |
|---|---|---|
| SMILESからInChIへ | SMILESからInChIを生成 | SMILESからInChIへを開く |
| SMILESからInChIKeyへ | SMILESをInChIKeyに変換 | SMILESからInChIKeyへを開く |
| InChIからSMILESへ | InChIをSMILESに戻す | InChIからSMILESへを開く |
| InChIKeyからSMILESへ | InChIKeyからSMILESを取得 | InChIKeyからSMILESへを開く |
| InChIからInChIKeyへ | 完全なInChIをInChIKeyに変換 | InChIからInChIKeyへを開く |
| InChIKeyからInChIへ | InChIKeyから完全なInChIを取得 | InChIKeyからInChIへを開く |
| IUPAC名からSMILESへ | 系統名をSMILESに変換 | IUPAC名からSMILESへを開く |
| SMILESからIUPAC名へ | SMILESからIUPAC名を生成 | SMILESからIUPAC名へを開く |
| CIDからSMILESへ | PubChem CIDからSMILESを取得 | CIDからSMILESへを開く |
| CASからSMILESへ | CAS番号をメタデータ付きでSMILESに変換 | CASからSMILESへを開く |
| CAS番号から構造式へ | CAS番号を検索し、2D構造式をSMILESとCID付きで表示 | CAS番号から構造式へを開く |
分子式・質量・分光のツール
| ツール | できること | リンク |
|---|---|---|
| 分子式・質量ツール | 分子式・質量ユーティリティのハブページ | 分子式・質量ツールを開く |
| 分子量計算ツール | 分子量、モル質量、元素の内訳、組成百分率 | 分子量計算ツールを開く |
| SMILES→分子式 | SMILESを分子式に変換 | SMILES→分子式を開く |
| SMILESから分子量へ | SMILESからメタデータ付きで分子量を計算 | SMILESから分子量へを開く |
| 精密質量計算ツール | 分子式からモノアイソトピック精密質量を計算 | 精密質量計算ツールを開く |
| マススペクトル予測ツール | 同位体パターンと分子イオン領域を予測 | マススペクトル予測ツールを開く |
| グラム・モル換算ツール | モル質量を使ってグラム ↔ モルを換算 | グラム・モル換算ツールを開く |
実験・化学量論・溶液の計算ツール
| ツール | できること | リンク |
|---|---|---|
| モル濃度計算ツール | 質量、分子量、体積からモル濃度を計算 | モル濃度計算ツールを開く |
| 質量モル濃度計算ツール | 溶質の量と溶媒の質量から質量モル濃度を計算 | 質量モル濃度計算ツールを開く |
| 希釈計算ツール | C1V1 = C2V2で原液と溶媒の体積を計算 | 希釈計算ツールを開く |
| 溶液調製計算ツール | 目標のモル濃度と最終体積に必要な溶質の質量 | 溶液調製計算ツールを開く |
| 化学反応式の係数合わせツール | プリセットとガイド付きで化学反応式の係数を合わせる | 化学反応式の係数合わせツールを開く |
| 限定反応物計算ツール | 限定反応物、過剰量、残量、理論収量 | 限定反応物計算ツールを開く |
| 収率計算ツール | 収率、実収量、理論収量 | 収率計算ツールを開く |
| pH計算ツール | pH、pOH、強酸・強塩基、緩衝液、pKaの計算補助 | pH計算ツールを開く |
| pKa計算ツール | pHからpKa、pKaからpH、ヘンダーソン・ハッセルバルヒの式 | pKa計算ツールを開く |
ドラッグライクネスと医薬品化学のツール
| ツール | できること | リンク |
|---|---|---|
| Lipinskiの法則 計算ツール | 5の法則：SMILESや名前から分子量、LogP、HBD、HBAを計算 | Lipinskiの法則 計算ツールを開く |
| ドラッグライクネス計算ツール | Lipinski＋Veber型のドラッグライクネススコア | ドラッグライクネス計算ツールを開く |
| LogP計算ツール | SMILESや化合物名からPubChemのXLogPを取得 | LogP計算ツールを開く |
| TPSA計算ツール | SMILESや名前からトポロジカル極性表面積を計算 | TPSA計算ツールを開く |
教育・リファレンス用ツール
| ツール | できること | リンク |
|---|---|---|
| インタラクティブ周期表 | 118元素すべてを電子配置、状態、質量とともに検索 | インタラクティブ周期表を開く |
| TLC図作成ツール | レーン、スポット、Rf値のラベル付きでTLCプレートを描いてエクスポート | TLC図作成ツールを開く |
| MolDrawコース | インタラクティブな化学コース | MolDrawコースを開く |
| 分子リファレンスページ | カフェイン、アスピリン、イブプロフェン、グルコースなど | 分子リファレンスページを開く |
| 反応ガイドのページ | アルドール反応、ウィッティヒ反応、グリニャール反応、鈴木カップリング、ヘック反応、ディールス・アルダー反応など | 反応ガイドのページを開く |
おすすめのワークフロー
学生・授業
- 構造式を描く：MolDrawエディター
- 化学反応式の係数を合わせる：化学反応式の係数合わせツール
- 実験の計算：モル濃度、希釈、収率
- TLCのレポート：TLC図作成ツール
- 周期表：インタラクティブ周期表
研究・ケモインフォマティクス
- 識別子の整理：SMILES ↔ InChI ↔ InChIKey変換ツール
- 登録番号の検索：CAS番号から構造式へ、CIDからSMILESへ
- ドッキングの準備：SMILESからPDBQTへ、PDB→PDBQT
- 初期のADMEスクリーニング：Lipinski、LogP、TPSA
計算化学
- 座標から2Dへ戻す：XYZ / Gaussianから2D構造式へ
- 座標からSMILESへ：XYZ→SMILES
- 3Dエクスポート：SMILESから3D構造へ
FAQ
MolDrawのツールは無料ですか？
はい。ここに掲載しているブラウザツールと計算ツールは、moldraw.comで無料で使えます。
アカウントは必要ですか？
ほとんどのツールでアカウントは不要です。メインのエディターと計算ツールはブラウザで動作します。一部のコミュニティ機能にはサインインが必要です。
ツールを最も早く見つける方法は？
化学ツール一覧を使うか、このガイドを入力の種類（SMILES、名前、分子式、XYZ、CASなど）で検索してください。
このリストを他のサイトに転載できますか？
はい。Scidart AcademyによるMolDrawの出典を明記すれば転載できます。外部公開用のMarkdown版もMolDrawリポジトリにあります。