CID→SMILES変換ツール
概要：化合物IDを化学のワークフロー向けにカノニカルSMILES文字列へ変換します。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。
PubChem CIDの値をカノニカルSMILES識別子に変換します。
入力形式と出力形式
| 入力：PubChem CID | 出力：SMILES | |
|---|---|---|
| 正式名称 | PubChem CID | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| 含まれる情報 | PubChemデータベースのレコードの化合物ID（Compound ID）。これを照会して構造を取得します。 | 原子、結合、環、電荷、立体化学を1行のテキストで表現。座標は含まない。 |
| ファイル・形式 | 2244のような整数 | .smi またはプレーンテキスト |
ファイル形式の解説
PubChem CIDは、PubChemが使う数値の化合物識別子です。分子構造を直接表すのではなく、データベースのレコードを指します。
SMILESは、分子の原子のつながりを表すコンパクトな線形表記法です。データベースからPubChem IDが得られても、描画ツールやケモインフォマティクスツールが構造の文字列を必要とする場合に、CIDからSMILESへの変換が役立ちます。
CIDの照会はPubChemのレコードに依存します。異なる化合物レコード、塩、同位体、立体化学的な形は、異なるCIDやSMILES文字列を持つことがあります。
PubChem CIDについて
PubChem Compound ID（CID）は、PubChemがデータベース内の各固有の化学構造に割り当てる数値識別子です。たとえばアスピリンはCID 2244、カフェインはCID 2519です。論文、試薬カタログ、データセットではCIDがよく引用されますが、数値だけでは構造はわかりません。SMILESに変換すれば、編集可能な構造の文字列が得られます。
使い方
- CIDを1つ入力します（数字のみ、「CID」の接頭辞は不要）。
- 変換を実行すると、PubChemからカノニカルSMILESを取得します。
- SMILESをMolDraw、スプレッドシート、他の変換ツールにコピーします。
FAQ
CIDはCAS番号と同じですか？いいえ。CAS登録番号はChemical Abstracts Serviceが割り当て、50-78-2のようにハイフンで区切られた形式です。CIDはPubChem独自の連番です。塩でドットを含むSMILESになるのはなぜですか？塩や混合物は別々の成分を含み、SMILESではそれらを[Na+].[Cl-]のようにドットで区切って書きます。
次のステップ：SMILESから構造式へで描くか、SMILESからInChIKeyへで識別子を取得します。
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