SMILESからIUPAC名への変換ツール
概要:SMILESをIUPAC名に即座に変換します。立体化学(E/Z、R/S)にも対応。無料でWebブラウザ上で動作し、インストールは不要です。
レポート、課題、命名の確認、化学識別子を扱う作業のために、SMILESをIUPAC名に変換します。
ヒント:calderasib や FMC-376 のような複雑な研究用コードは、PubChemに該当するレコードがある場合にのみ解決されることがあります。
入力形式と出力形式
| 入力:SMILES | 出力:IUPAC名 | |
|---|---|---|
| 正式名称 | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | IUPAC名 |
| 含まれる情報 | 原子、結合、環、電荷、立体化学を1行のテキストで表現。座標は含まない。 | IUPAC命名法の規則に従って作られる系統的な化学名。 |
| ファイル・形式 | .smi またはプレーンテキスト | テキスト |
ファイル形式の解説
SMILESは、検索、変換、ケモインフォマティクスの作業で使われるコンパクトな分子の線形表記法です。正式な命名ではなく、機械処理向けに最適化されています。
IUPAC名は、化合物を正式な言葉で表すための系統的な化学名です。レポート、課題、論文、命名の確認に役立ちます。
1つの分子に、許容される名前や等価なSMILES文字列が複数存在することがあります。データベースに基づく命名は、結合関係、電荷、立体化学が明確な既知化合物で最もうまく機能します。
このSMILES→IUPAC名変換ツールのしくみ
このツールはSMILES文字列をPubChemのプロパティ検索に送信し、返されたIUPAC名を表示します。先に化合物名やCIDでPubChemを検索し、PubChemのSMILESをインポートして自動的に変換することもできます。
- コンパクトな分子識別子としてはSMILESを使います。
- 正式なレポート、命名の確認、検索可能な化学的記述にはIUPAC名を使います。
- 結果が見つからない場合は、入力したSMILESの立体化学、電荷、塩、特殊なフラグメントを確認してください。
- あまり一般的でない医薬品コードや研究用化合物の場合は、コード名とPubChem CID(あれば)の両方を試してください。
関連する化学ツール
SMILESがわからない場合は?分子を描いて、そのIUPAC名を直接取得できます。
構造式からIUPAC名へよくある質問
SMILESをIUPAC名に変換するには?
SMILES文字列を貼り付けて「変換」をクリックします。MolDrawがSMILESをPubChemに送信し、PubChemが構造を標準化して、立体表示子を含む計算済みのIUPAC名を返します。
/ や \ を含むSMILESが他の変換ツールで失敗するのはなぜですか?
スラッシュ(E/Z二重結合)や #(三重結合)はURLベースの検索を壊してしまいます。この変換ツールはSMILESをリクエスト本文で送信するため、C/C=C/C(=O)O のような立体SMILESも正しく処理され、(E)-but-2-enoic acid が返されます。
PubChemに登録されていない分子にも名前を付けられますか?
通常はできません。自動命名は1億件を超える化合物を収録したPubChemのデータベースに依存しています。新規構造の場合は手作業で命名するか、類似化合物の名前を基に調整してください。
SMILESを入力する代わりに構造式を描けますか?
はい。エディターを内蔵した「構造式からIUPAC名へ」ツールを使えば、分子を描くと名前が自動的に更新されます。
SMILES→IUPAC名変換ツールは無料ですか?
はい。無料・登録不要で、ブラウザ上で動作します。
アスピリンのような医薬品ではどの名前が返されますか?
商品名や慣用名ではなく、系統的なIUPAC名が返されます。例えばアスピリンなら 2-acetyloxybenzoic acid です。
構造式を描きたい場合は、無料のオンラインChemDraw代替ツールであるMolDrawで化学構造式をオンラインで描画できます。
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