SMILES分子量計算ツール
概要:SMILES文字列を貼り付けると、分子量、分子式、IUPAC名、PubChem CID(ある場合)を取得できます。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。
SMILES文字列を貼り付けると分子量を計算し、PubChemに化合物レコードがあれば対応する分子式も取得します。
要点:SMILESを貼り付けて、分子量をg/molで計算します。
ここに分子量が表示されます。
SMILESからの分子量検索のしくみ
このツールはSMILES文字列をPubChemで照合し、一致した化合物レコードから分子量の値を読み取ります。
- 分子式だけから計算する場合は、分子量計算ツールを使ってください。
- 質量分析で分子式を確認する場合は、平均分子量ではなく精密質量を使ってください。
分子量と精密質量の違い
分子量(モル質量)は、天然の同位体存在比で平均した標準原子量から計算します。炭素は約12.011、水素は1.008、酸素は15.999、窒素は14.007です。試薬の秤量や溶液の調製にはこの値を使います。精密質量(モノアイソトピック質量)は各元素の最も存在比の大きい同位体だけを使った値で、高分解能マススペクトルと比較するときに使います。
計算例
アスピリン CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O は C9H8O4 です。
9 × 12.011 + 8 × 1.008 + 4 × 15.999 = 108.099 + 8.064 + 63.996 = 180.16 g/mol。モノアイソトピック質量は約180.042 Daです。
実際の使い方
- 0.1 Mの溶液を100 mLつくるには0.01 molが必要で、これはアスピリン1.80 gに相当します。
- 水和物や塩の場合は、秤量する試薬びんの表示と分子量が一致するよう、対イオンと水もSMILESに含めてください。
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