SDF→InChIKey変換ツール

概要：SDFまたはMOLブロックを、データベース照合用の標準InChIKey識別子に変換します。無料でWebブラウザ上で動作し、インストールは不要です。

SDFまたはMOLブロックを貼り付けて、標準InChIKeyに変換します。

ファイル形式の解説

SDFは原子・結合ブロックと化合物の物性を格納できる構造データ形式です。化学データセットやスクリーニングライブラリで広く使われています。

InChIKeyはInChIから導かれるコンパクトなハッシュ化識別子です。データベース照合、インデックス作成、2つのレコードが同じ化合物を表しているかの確認に特に役立ちます。

InChIKeyは検索しやすい反面、完全には元に戻せません。後で座標、原子ブロック、物性フィールドが必要になる場合は、元のSDFを保管しておいてください。

化合物ライブラリでInChIKeyを使う

化合物ライブラリをSDFで受け取ったとき、各レコードのInChIKeyは構造の短く検索可能な指紋になります。キーはスプレッドシートやデータベースに収まりやすく、異なる名前やIDで登録された同じ化合物も簡単に見つけられます。

使い方

1. $$$$で終わるSDFレコードを1件以上コピーします。
2. 貼り付けて変換します。
3. 得られた27文字のキーを、スプレッドシートの化合物IDの横にコピーします。

実用的な使い方

• 重複の除去：InChIKeyで並べ替えます。同一のキーは、立体化学も含めて同じ構造であることを示します。
• 立体異性体の検出：最初の14文字のブロックでグループ化すると、骨格が共通で立体や同位体だけが異なる化合物をまとめられます。
• 相互参照：公開データベースでキーを検索して、文献、供給元、安全性データを探します。

注意：SDFレコード中の塩や混合物ではレコード全体に対するキーが生成されるため、塩酸塩とそのフリー体は異なるキーになります。親化合物で照合したい場合は、先に対イオンを取り除いてください。完全な識別子にはSDF→InChIを使ってください。