MOLからSMILESへの変換ツール
概要:MOL/SDFの内容を貼り付けて、オンラインでSMILESに変換します。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。
MOL/SDFブロックを貼り付け、アップロード、またはPubChemからインポートして、SMILESに変換します。このツールはまずPubChemでの変換を試み、可能な場合はNCI Cactusに切り替えます。
MOL/SDFの内容を貼り付けるか、ファイルをアップロードするか、PubChemから2D SDFレコードをインポートします。
ここにSMILESが表示されます。
入力形式と出力形式
| 入力:MOLファイル | 出力:SMILES | |
|---|---|---|
| 正式名称 | MOLファイル(MDL Molfile) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| 含まれる情報 | 1分子の2Dまたは3D座標つき原子リストと結合テーブル。 | 原子、結合、環、電荷、立体化学を1行のテキストで表現。座標は含まない。 |
| ファイル・形式 | .mol | .smi またはプレーンテキスト |
ファイル形式の解説
MOLファイルとSDFファイルは、原子ブロックと結合ブロックを保存し、多くの場合2Dまたは3D座標を含みます。編集可能な構造のやり取りや化合物データの記録に便利です。
SMILESは、その構造をコンパクトな1行のテキスト表記に変換します。検索、識別子、スクリプト、Webツールに便利です。
MOLやSDFをSMILESに変換するときは、立体化学、電荷、塩、芳香族性を確認してください。元のファイルの座標や物性データの一部はSMILESには保持されません。
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