IUPAC名→SMILES変換ツール
概要：系統名をSMILESに変換するか、名前やCIDでPubChemから化合物をインポートします。無料でWebブラウザ上で動作し、インストールは不要です。
IUPAC名やPubChemの化合物名をSMILESに変換します。文献の化合物名を構造文字列にするのに便利です。名前は英語で入力してください。
ここにSMILESが表示されます。
入力形式と出力形式
| 入力：IUPAC名 | 出力：SMILES | |
|---|---|---|
| 正式名称 | IUPAC名 | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| 含まれる情報 | IUPAC命名法の規則に従って作られる系統的な化学名。 | 原子、結合、環、電荷、立体化学を1行のテキストで表現。座標は含まない。 |
| ファイル・形式 | テキスト | .smi またはプレーンテキスト |
ファイル形式の解説
IUPAC名は構造を系統的に表すために作られた正式な化学名です。論文や教育で役立ちますが、長い名前はソフトウェアに入力しにくいことがあります。
SMILESは描画ツール、データベース、ケモインフォマティクスのスクリプト、変換ツールで使われるコンパクトな構造文字列です。IUPAC名をSMILESに変換すれば、文献中の名前を機械可読な構造にできます。
名前の解決は、あいまいさがなく広く認知された名前で最もうまく機能します。塩、混合物、立体化学、慣用名、つづりの揺れがあると、結果が得られないか別のレコードが返されることがあります。
名前→SMILES変換のコツ
IUPAC系統名は構造を正確に表しますが、長く入力ミスもしやすくなります。名前をSMILESに変換すれば、描画ツールやスプレッドシートに貼り付けられるコンパクトで機械可読な構造が得られます。
例
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid（アスピリン）→
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid（L-アラニン）→
C[C@@H](C(=O)O)N
よい結果を得るために
- 位置番号、コンマ、ハイフン、かっこを含めて名前を正確にコピーしてください。1,2-dichloroethaneと1,1-dichloroethaneは別の化合物です。
- 特定の異性体が必要な場合は(R)、(S)、(E)、(Z)などの立体表示子を含めてください。含めないと立体化学が未定義のままになることがあります。
- caffeineのような慣用名でも多くの場合は変換できますが、ごく新しい商品名やまれな商品名では変換できないことがあります。
- PDFからコピーした特殊なダッシュやプライムなどの組版用文字に注意し、通常のハイフンやアポストロフィに置き換えてください。
逆方向の変換はSMILES→IUPAC名を使ってください。
最終更新：