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無料のマススペクトルビューア

概要:JCAMP-DX、CSV、mzML、mzXMLのファイルを開き、ピークのラベル付け、分子式・SMILES・ペプチドの同位体パターンの重ね描き、付加イオン・ppm誤差・中性脱離の確認、PNG・CSVでのエクスポートができます。無料でWebブラウザ上で動作し、インストールは不要です。

マススペクトルを開いてピークにラベルを付け、分子式、SMILES、ペプチドの同位体パターンと比較できます。付加イオン、ppm誤差、中性脱離も確認できます。ファイルはお使いのデバイスから外に出ません。

またはここにドロップ。JCAMP-DX(.jdx、.dx)、CSV/TXT(m/z、強度)、mzMLまたはmzXML(最初のスペクトル)。

例を読み込む:

例はシミュレーションで、自由に再利用できます。サンプル.jdxをダウンロード。

分子式、SMILES、またはペプチド

マススペクトルビューアの使い方

  1. ファイルを開くか、例のボタンを押します。
  2. 「スティック」または「プロファイル」を選び、見たい範囲を拡大し、正規化するには「基準ピーク = 100%」にチェックを入れます。
  3. 分子式、SMILES、またはペプチドを入力し、[M+H]+などのイオンを選びます。赤い棒が理論上の同位体パターンを示します。
  4. 測定したピークをタップするとppm誤差が求まります。付加イオンの表で、どの一般的なイオンが存在するかがわかります。
  5. 主要なピーク間の中性脱離のラベルを読みます。
  6. PNGまたはCSVをエクスポートします。

マススペクトルの読み方

各ピークは、そのm/z(質量を電荷で割った値)にあるイオンです。最も高いピークが基準ピークで、100%に設定されます。EIスペクトルでは分子イオンM+•が小さいことが多く、フラグメントが多くの情報を持ちます。ESIでは主に[M+H]+、[M+Na]+、[M-H]-が観測され、ペプチドのような大きな分子では2+や3+のイオンも現れ、その同位体ピークは0.5や0.33間隔になります。

同位体:炭素13はMより1大きい位置にピークを加え、その強度は炭素1個あたり約1.1%です。塩素と臭素はMより2大きい位置に強いピークを加えます。ピーク間の−18(H2O)、−28(CO)、−44(CO2)、−35(Cl)などの中性脱離から、どの基が外れたかがわかります。

よくある質問

データはアップロードされますか?

いいえ。ファイルはブラウザ内でのみ読み込まれ、描画されます。

どのファイルを開けますか?

JCAMP-DXのマススペクトル(ピーク表と連続データ)、m/zと強度の列を持つCSVまたはTXT、mzMLまたはmzXMLです。mzMLとmzXMLでは最初のスペクトルが表示されます。圧縮(zlib)配列も最新のブラウザで扱えます。

モノアイソトピック質量、平均質量、精密質量の違いは何ですか?

モノアイソトピック質量は、各元素で最も存在比の大きい同位体(12C、1H、35Cl)を使います。平均質量は天然存在比を用いたもので、天秤で量る質量です。精密m/zは、付加または除去された原子と電子の質量を含めた、観測されるイオンのモノアイソトピック質量です。

塩素や臭素の有無を確認するには?

分子式を入力してパターンを見ます。Clが1つならM+2ピークはMの約3分の1(3:1)になります。Brが1つならMとM+2はほぼ等しく(1:1)、Brが2つなら1:2:1になります。赤い棒が理論値をデータに重ねて示します。

ppm誤差はどのように求めますか?

ppm =(測定値 − 理論値)/ 理論値 × 1 000 000 です。ピークをタップすると測定値として使われます。高分解能データでは、約5 ppm以内なら良い一致です。

中性脱離のラベルとは何ですか?

ツールは主要なピーク間の差を調べ、H2O、NH3、CO、CO2、CH3、HCl、Cl、Brなどの一般的な小さな中性脱離に名前を付けます。同位体ピークは除外されます。単位分解能ではCOとC2H4は区別できないため、両方が表示されることがあります。

同位体の数値はどこから来ていますか?

同位体の質量と天然存在比は、IUPAC(CIAAW)とNISTが公開している参照値です。パターンはすべての原子の同位体を組み合わせて計算しています。

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