XYZ / Gaussianから2D構造式への変換ツール
概要：XYZ、Gaussianの.gjf・.com、または座標テキストを貼り付けるかアップロードすると、結合を推定した編集可能な2D分子構造キャンバスを生成します。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。
XYZ、Gaussian入力、またはデカルト座標のテキストを貼り付けるかアップロードすると、結合を推定した編集可能な2D構造キャンバスを生成します。
要点：このツールは原子座標を読み取り、共有結合半径から可能性の高い結合を推定し、3D構造を2Dに投影して、結果を埋め込みエディターに読み込みます。SVG、PNG、または推定したMOLファイルとして書き出せます。
入力座標
準備完了。座標を貼り付けて変換してください。
編集可能な2D構造式
エディターを読み込み中...推定した静的SVGプレビュー
ここに2D構造式のプレビューが表示されます。
推定したMOLブロック
MOL output appears here.
ファイル形式の解説
XYZは原子記号と3D座標を保存する形式で、通常は結合次数、電荷、芳香族性、立体化学を含みません。計算化学や量子化学のワークフローでよく使われます。
.gjfや.comなどのGaussian入力ファイルには、多くの場合、電荷／スピン多重度の行とそれに続くデカルト座標が含まれます。このツールは可能な場合、それらの座標ブロックを抽出します。
XYZやGaussianの座標ファイルには通常結合次数が保存されていないため、出力はできる限り推定した2D構造式です。論文、ドッキング、その後のケモインフォマティクスに使う前に、埋め込みの2Dキャンバスで推定された結合を修正してください。
最終更新：