MOL→InChI変換ツール

概要：MOLやSDFの構造ブロックを、化学データのワークフロー向けに標準InChI識別子へ変換します。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。

MOLまたはSDFのブロックを貼り付けると、標準InChI識別子に変換します。

ファイル形式の解説

MOLは、分子を原子表と結合表として保存し、多くの場合2Dまたは3D座標を含みます。編集可能な構造のやり取りに便利です。

InChIは、構造から生成される標準化されたテキスト識別子です。検索、索引付け、登録、データベース間での化学物質レコードの比較に便利です。

変換の品質は、MOLファイルの原子、結合、電荷、立体化学が明確かどうかによります。塩、互変異性体、立体化学レイヤーについては、生成されたInChIを確認してください。

MOLファイルについて

MOLファイル（MDL Molfile）は、1つの構造を結合表として保存します。ヘッダー、カウント行、x・y・z座標と元素記号を含む原子ブロック、どの原子がどの結合次数でつながっているかを示す結合ブロックからなります。ほとんどの化学ソフトウェアがMOLを書き出せるため、一般的な交換形式になっています。古典的な固定桁形式のV2000と、より大きな分子や多くの機能に対応したV3000の2つのバージョンがあります。

InChIに変換する理由

InChIは、原子の順序や描画座標に依存しない標準識別子を与えます。同じ分子を別々に描いた2つのMOLファイルから同じ標準InChIが得られるため、重複の確認やデータベースの検索が簡単になります。

使い方

1. .molファイルをテキストエディターで開き、ヘッダー行と最後のM END行を含めてすべてコピーします。
2. 入力欄に貼り付けて変換します。
3. InChIをコピーするか、InChI→InChIKeyでさらに短くします。

トラブルシューティング：MOLファイルは桁位置に依存するため、ワープロソフトで整形されたファイルは失敗することがあります。プレーンテキストエディターからコピーしてください。