MolDraw 全部免费化学工具完整指南
这是 MolDraw 全部免费化学工具的完整链接目录,包括转换器、计算器、绘图工具和教学资源。可以把它当作快速参考,也可以在注明来源 MolDraw 的前提下分享到其他网站。
快速指南:如何使用 MolDraw 工具
MolDraw 是一个免费的浏览器化学平台。大多数工作流程都不需要安装软件。
- 绘制或编辑结构 —— 打开 MolDraw 编辑器,进行 2D 绘图、3D 查看、SMILES 导出和下载。
- 浏览全部工具 —— 从化学工具首页或免费化学工具目录开始。
- 选择与输入相匹配的工具 —— SMILES、名称、分子式、XYZ 坐标、CAS 号、MOL/SDF 数据块等。
- 转换或计算 —— 在浏览器中运行工具,然后复制结果或下载文件。
- 返回编辑器 —— 许多工具都链接回 MolDraw,方便你进一步编辑结构。
适合人群:需要快速化学工具、又不想安装桌面软件的学生、教师、实验室团队和科研人员。
绘图与结构工具
| 工具 | 功能 | 链接 |
|---|---|---|
| MolDraw 编辑器 | 2D 绘图、3D 查看、名称检索、PNG/SVG/SDF/XYZ/PDB 导出 | 打开 MolDraw 编辑器 |
| 化学反应式绘制工具 | 绘制包含反应物、产物、箭头、试剂和条件的反应式 | 打开化学反应式绘制工具 |
| SMILES 转结构式 | 粘贴 SMILES,显示 2D 结构 | 打开 SMILES 转结构式 |
| 结构转 SMILES | 在 2D 编辑器中绘图,实时得到 SMILES | 打开结构转 SMILES |
| SMILES 转 3D 结构 | 3D 查看,并可下载 PNG、SDF、XYZ、PDB、MOL、OBJ、X3D | 打开 SMILES 转 3D 结构 |
| XYZ / Gaussian 转 2D | 把 XYZ、.gjf 或 .com 坐标转换为推断出的 2D 结构 | 打开 XYZ / Gaussian 转 2D |
| XYZ 转 SMILES | 把 XYZ 坐标转换为 SMILES,并可编辑整理 | 打开 XYZ 转 SMILES |
| 名称转结构式 | 由名称得到 2D 结构、SMILES、分子式、分子量和 PubChem CID | 打开名称转结构式 |
| 分子式转结构式 | 检索 C9H8O4 等分子式并比较 PubChem 候选结构 | 打开分子式转结构式 |
| 路易斯结构式生成器 | 根据分子式和电荷构建路易斯电子式 | 打开路易斯结构式生成器 |
| 蛋白质查看器 | 按 PDB ID 或文件载入蛋白质;导出多种格式 | 打开蛋白质查看器 |
SMILES、MOL、SDF、PDB 及文件转换器
| 工具 | 功能 | 链接 |
|---|---|---|
| SMILES 转 MOL | 把 SMILES 转换为 MOL,用于编辑器/电子实验记录本流程 | 打开 SMILES 转 MOL |
| SMILES 转 SDF | 由 SMILES 生成 SDF,用于数据集 | 打开 SMILES 转 SDF |
| SMILES 转 MOL2 | 把 SMILES 转换为 MOL2,用于对接准备 | 打开 SMILES 转 MOL2 |
| SMILES 转 PDB | 把 SMILES 转换为可下载的 3D PDB | 打开 SMILES 转 PDB |
| SMILES 转 PDBQT | 把 SMILES 转换为 PDBQT,用于分子对接 | 打开 SMILES 转 PDBQT |
| MOL 转 SMILES | 把 MOL/SDF 数据块转换为 SMILES | 打开 MOL 转 SMILES |
| MOL2 转 SMILES | 把 MOL2 配体数据块转换为 SMILES | 打开 MOL2 转 SMILES |
| PDB 转 SMILES | 把配体 PDB 文本转换为 SMILES | 打开 PDB 转 SMILES |
| PDB 转 PDBQT | 把 PDB 坐标转换为 PDBQT | 打开 PDB 转 PDBQT |
| SDF 转 InChI | 把 SDF/MOL 数据块转换为 InChI | 打开 SDF 转 InChI |
| SDF 转 InChIKey | 由 SDF/MOL 数据块生成 InChIKey | 打开 SDF 转 InChIKey |
| MOL 转 InChI | 把 MOL/SDF 转换为 InChI | 打开 MOL 转 InChI |
| MOL 转 InChIKey | 把 MOL/SDF 转换为 InChIKey | 打开 MOL 转 InChIKey |
InChI、InChIKey、IUPAC、CID 和 CAS 工具
| 工具 | 功能 | 链接 |
|---|---|---|
| SMILES 转 InChI | 由 SMILES 生成 InChI | 打开 SMILES 转 InChI |
| SMILES 转 InChIKey | 把 SMILES 转换为 InChIKey | 打开 SMILES 转 InChIKey |
| InChI 转 SMILES | 把 InChI 转换回 SMILES | 打开 InChI 转 SMILES |
| InChIKey 转 SMILES | 由 InChIKey 解析出 SMILES | 打开 InChIKey 转 SMILES |
| InChI 转 InChIKey | 把完整 InChI 转换为 InChIKey | 打开 InChI 转 InChIKey |
| InChIKey 转 InChI | 由 InChIKey 解析出完整 InChI | 打开 InChIKey 转 InChI |
| IUPAC 名称转 SMILES | 把系统命名转换为 SMILES | 打开 IUPAC 名称转 SMILES |
| SMILES 转 IUPAC 名称 | 由 SMILES 生成 IUPAC 名称 | 打开 SMILES 转 IUPAC 名称 |
| CID 转 SMILES | 由 PubChem CID 解析出 SMILES | 打开 CID 转 SMILES |
| CAS 转 SMILES | 把 CAS 号转换为 SMILES 并附元数据 | 打开 CAS 转 SMILES |
| CAS 转结构式 | 查询 CAS 号并显示 2D 结构、SMILES 和 CID | 打开 CAS 转结构式 |
分子式、质量和波谱工具
| 工具 | 功能 | 链接 |
|---|---|---|
| 分子式与质量工具 | 分子式与质量工具的汇总页 | 打开分子式与质量工具 |
| 分子量计算器 | 分子量、摩尔质量、元素组成和质量百分组成 | 打开分子量计算器 |
| SMILES 转分子式 | 把 SMILES 转换为分子式 | 打开 SMILES 转分子式 |
| SMILES 转分子量 | 由 SMILES 计算分子量并附元数据 | 打开 SMILES 转分子量 |
| 精确质量计算器 | 由分子式计算单同位素精确质量 | 打开精确质量计算器 |
| 质谱预测器 | 预测同位素峰型和分子离子区 | 打开质谱预测器 |
| 克转摩尔计算器 | 利用摩尔质量进行克 ↔ 摩尔换算 | 打开克转摩尔计算器 |
实验室、化学计量和溶液计算器
| 工具 | 功能 | 链接 |
|---|---|---|
| 摩尔浓度计算器 | 由质量、分子量和体积计算物质的量浓度 | 打开摩尔浓度计算器 |
| 质量摩尔浓度计算器 | 由溶质的量和溶剂质量计算质量摩尔浓度 | 打开质量摩尔浓度计算器 |
| 稀释计算器 | 用 C1V1 = C2V2 计算储备液和溶剂体积 | 打开稀释计算器 |
| 溶液配制计算器 | 按目标浓度和最终体积计算溶质质量 | 打开溶液配制计算器 |
| 化学方程式配平器 | 借助预设和提示配平方程式 | 打开化学方程式配平器 |
| 限量试剂计算器 | 限量反应物、过量反应物、剩余量和理论产量 | 打开限量试剂计算器 |
| 产率计算器 | 产率、实际产量或理论产量 | 打开产率计算器 |
| pH 计算器 | pH、pOH、强酸/强碱、缓冲溶液和 pKa 辅助计算 | 打开 pH 计算器 |
| pKa 计算器 | 由 pH 求 pKa、由 pKa 求 pH、Henderson–Hasselbalch 方程 | 打开 pKa 计算器 |
类药性与药物化学工具
| 工具 | 功能 | 链接 |
|---|---|---|
| Lipinski 规则计算器 | 五规则:由 SMILES 或名称计算 MW、LogP、HBD、HBA | 打开 Lipinski 规则计算器 |
| 类药性计算器 | Lipinski + Veber 式类药性评分 | 打开类药性计算器 |
| LogP 计算器 | 由 SMILES 或化合物名称获取 PubChem XLogP | 打开 LogP 计算器 |
| TPSA 计算器 | 由 SMILES 或名称计算拓扑极性表面积 | 打开 TPSA 计算器 |
教学与参考工具
| 工具 | 功能 | 链接 |
|---|---|---|
| 交互式元素周期表 | 检索全部 118 种元素,包括电子排布、物态和质量 | 打开交互式元素周期表 |
| TLC 示意图工具 | 绘制带泳道、斑点和 Rf 标注的 TLC 板并导出 | 打开 TLC 示意图工具 |
| MolDraw 课程 | 交互式化学课程 | 打开 MolDraw 课程 |
| 分子参考页面 | 咖啡因、阿司匹林、布洛芬、葡萄糖等 | 打开分子参考页面 |
| 反应指南页面 | 羟醛缩合、Wittig、Grignard、Suzuki、Heck、Diels–Alder 等反应 | 打开反应指南页面 |
推荐工作流程
学生或课堂
科研或化学信息学
- 标识符整理:SMILES ↔ InChI ↔ InChIKey 转换器
- 登记号查询:CAS 转结构式、CID 转 SMILES
- 对接准备:SMILES 转 PDBQT、PDB 转 PDBQT
- 早期 ADME 初筛:Lipinski、LogP、TPSA
计算化学
- 坐标转回 2D:XYZ / Gaussian 转 2D 结构
- 坐标转 SMILES:XYZ 转 SMILES
- 3D 导出:SMILES 转 3D 结构
常见问题
MolDraw 工具免费吗?
免费。这里列出的浏览器工具和计算器都可以在 moldraw.com 免费使用。
需要注册账户吗?
大多数工具无需账户。主编辑器和计算器都可以直接在浏览器中使用。部分社区功能需要登录。
找到工具最快的方法是什么?
使用化学工具首页,或在本指南中按输入类型(SMILES、名称、分子式、XYZ、CAS 等)查找。
可以把这份列表转载到其他网站吗?
可以,但需注明来源为 Scidart Academy 的 MolDraw。MolDraw 代码仓库中还提供 Markdown 版本,便于对外发布。