Полное руководство по всем бесплатным химическим инструментам MolDraw
Это полный каталог со ссылками на все бесплатные химические инструменты MolDraw — конвертеры, калькуляторы, утилиты для рисования и учебные ресурсы. Используйте его как краткий справочник или публикуйте на других сайтах со ссылкой на MolDraw.
Краткое руководство: как пользоваться инструментами MolDraw
MolDraw — бесплатная химическая платформа в браузере. Для большинства задач не нужно устанавливать программы.
- Нарисуйте или измените структуру — откройте редактор MolDraw для 2D-рисования, 3D-просмотра, экспорта SMILES и скачивания файлов.
- Просмотрите все инструменты — начните с химических инструментов или каталога бесплатных химических инструментов.
- Выберите инструмент под ваши входные данные — SMILES, название, формула, координаты XYZ, номер CAS, блок MOL/SDF и т. д.
- Конвертируйте или рассчитайте — запустите инструмент в браузере, затем скопируйте результат или скачайте файл.
- Вернитесь в редактор — многие инструменты ссылаются обратно на MolDraw, если нужно продолжить правку структуры.
Кому подходит: студентам, преподавателям, лабораторным группам и исследователям, которым нужны быстрые химические утилиты без настольных программ.
Редактор MolDrawРисование, 3D-просмотр, экспорт форматовОткрыть редактор →
Химические инструментыВсе категории инструментовОткрыть раздел →
Каталог инструментовИндексированные адреса инструментовОткрыть каталог →
Краткий обзор инструментовОбзорная статья по группамЧитать →
Инструменты рисования и работы со структурами
| Инструмент | Что делает | Ссылка |
|---|---|---|
| Редактор MolDraw | 2D-рисование, 3D-просмотр, поиск по названию, экспорт PNG/SVG/SDF/XYZ/PDB | Открыть редактор MolDraw |
| Рисование химических реакций | Рисование реакций с реагентами, продуктами, стрелками, вспомогательными веществами и условиями | Открыть: Рисование химических реакций |
| SMILES в структуру | Вставьте SMILES и получите 2D-структуру | Открыть: SMILES в структуру |
| Структура в SMILES | Рисуйте в 2D-редакторе и получайте SMILES в реальном времени | Открыть: Структура в SMILES |
| SMILES в 3D-структуру | 3D-просмотр и скачивание PNG, SDF, XYZ, PDB, MOL, OBJ, X3D | Открыть: SMILES в 3D-структуру |
| XYZ / Gaussian в 2D | Перевод координат XYZ, .gjf или .com в восстановленную 2D-структуру | Открыть: XYZ / Gaussian в 2D |
| XYZ в SMILES | Перевод координат XYZ в SMILES с редактируемой очисткой | Открыть: XYZ в SMILES |
| Название в структуру | Названия в 2D-структуру, SMILES, формулу, MW, PubChem CID | Открыть: Название в структуру |
| Формула в структуру | Поиск по формулам вроде C9H8O4 и сравнение кандидатов из PubChem | Открыть: Формула в структуру |
| Генератор структур Льюиса | Построение электронных структур Льюиса по формуле и заряду | Открыть: Генератор структур Льюиса |
| Просмотр белков | Загрузка белков по PDB ID или из файла; экспорт форматов | Открыть: Просмотр белков |
Конвертеры SMILES, MOL, SDF, PDB и файлов
| Инструмент | Что делает | Ссылка |
|---|---|---|
| SMILES в MOL | Перевод SMILES в MOL для редакторов и электронных лабораторных журналов | Открыть: SMILES в MOL |
| SMILES в SDF | Создание SDF из SMILES для наборов данных | Открыть: SMILES в SDF |
| SMILES в MOL2 | Перевод SMILES в MOL2 для подготовки к докингу | Открыть: SMILES в MOL2 |
| SMILES в PDB | Перевод SMILES в 3D-файл PDB для скачивания | Открыть: SMILES в PDB |
| SMILES в PDBQT | Перевод SMILES в PDBQT для докинга | Открыть: SMILES в PDBQT |
| MOL в SMILES | Перевод блоков MOL/SDF в SMILES | Открыть: MOL в SMILES |
| MOL2 в SMILES | Перевод блоков лигандов MOL2 в SMILES | Открыть: MOL2 в SMILES |
| PDB в SMILES | Перевод текста PDB лиганда в SMILES | Открыть: PDB в SMILES |
| PDB в PDBQT | Преобразование координат PDB в PDBQT | Открыть: PDB в PDBQT |
| SDF в InChI | Перевод блоков SDF/MOL в InChI | Открыть: SDF в InChI |
| SDF в InChIKey | Создание InChIKey из блоков SDF/MOL | Открыть: SDF в InChIKey |
| MOL в InChI | Перевод MOL/SDF в InChI | Открыть: MOL в InChI |
| MOL в InChIKey | Перевод MOL/SDF в InChIKey | Открыть: MOL в InChIKey |
Инструменты для InChI, InChIKey, IUPAC, CID и CAS
| Инструмент | Что делает | Ссылка |
|---|---|---|
| SMILES в InChI | Создание InChI из SMILES | Открыть: SMILES в InChI |
| SMILES в InChIKey | Перевод SMILES в InChIKey | Открыть: SMILES в InChIKey |
| InChI в SMILES | Обратный перевод InChI в SMILES | Открыть: InChI в SMILES |
| InChIKey в SMILES | Поиск SMILES по InChIKey | Открыть: InChIKey в SMILES |
| InChI в InChIKey | Перевод полного InChI в InChIKey | Открыть: InChI в InChIKey |
| InChIKey в InChI | Поиск полного InChI по InChIKey | Открыть: InChIKey в InChI |
| IUPAC в SMILES | Перевод систематических названий в SMILES | Открыть: IUPAC в SMILES |
| SMILES в IUPAC | Создание названий IUPAC из SMILES | Открыть: SMILES в IUPAC |
| CID в SMILES | Поиск SMILES по PubChem CID | Открыть: CID в SMILES |
| CAS в SMILES | Перевод номеров CAS в SMILES с метаданными | Открыть: CAS в SMILES |
| CAS в структуру | Поиск по CAS с 2D-структурой, SMILES и CID | Открыть: CAS в структуру |
Инструменты для формул, масс и спектроскопии
| Инструмент | Что делает | Ссылка |
|---|---|---|
| Инструменты для формул и масс | Обзорная страница утилит для формул и масс | Открыть: Инструменты для формул и масс |
| Калькулятор молекулярной массы | MW, молярная масса, элементный состав, массовые доли | Открыть: Калькулятор молекулярной массы |
| SMILES в молекулярную формулу | Перевод SMILES в молекулярную формулу | Открыть: SMILES в молекулярную формулу |
| SMILES в молекулярную массу | Расчёт MW по SMILES с метаданными | Открыть: SMILES в молекулярную массу |
| Калькулятор точной массы | Моноизотопная точная масса по формуле | Открыть: Калькулятор точной массы |
| Предсказание масс-спектра | Предсказание изотопного распределения и области молекулярного иона | Открыть: Предсказание масс-спектра |
| Калькулятор граммов в моли | Перевод граммов ↔ молей по молярной массе | Открыть: Калькулятор граммов в моли |
Калькуляторы для лаборатории, стехиометрии и растворов
| Инструмент | Что делает | Ссылка |
|---|---|---|
| Калькулятор молярности | Молярность по массе, MW и объёму | Открыть: Калькулятор молярности |
| Калькулятор моляльности | Моляльность по количеству растворённого вещества и массе растворителя | Открыть: Калькулятор моляльности |
| Калькулятор разбавления | C1V1 = C2V2 для объёмов исходного раствора и растворителя | Открыть: Калькулятор разбавления |
| Калькулятор приготовления растворов | Масса растворённого вещества для заданной молярности и конечного объёма | Открыть: Калькулятор приготовления растворов |
| Уравнивание химических реакций | Уравнивание реакций с готовыми примерами и подсказками | Открыть: Уравнивание химических реакций |
| Калькулятор лимитирующего реагента | Лимитирующий реагент, избыток, остаток, теоретический выход | Открыть: Калькулятор лимитирующего реагента |
| Калькулятор выхода продукта | Выход в процентах, практический или теоретический выход | Открыть: Калькулятор выхода продукта |
| Калькулятор pH | pH, pOH, сильные кислоты/основания, буферы и помощь с pKa | Открыть: Калькулятор pH |
| Калькулятор pKa | pKa по pH, pH по pKa, уравнение Хендерсона–Хассельбаха | Открыть: Калькулятор pKa |
Инструменты для лекарственного подобия и медицинской химии
| Инструмент | Что делает | Ссылка |
|---|---|---|
| Калькулятор правила Липински | Правило пяти: MW, LogP, HBD, HBA по SMILES или названию | Открыть: Калькулятор правила Липински |
| Калькулятор лекарственного подобия | Оценка лекарственного подобия по Липински и Веберу | Открыть: Калькулятор лекарственного подобия |
| Калькулятор LogP | XLogP из PubChem по SMILES или названию соединения | Открыть: Калькулятор LogP |
| Калькулятор TPSA | Топологическая полярная площадь поверхности по SMILES или названию | Открыть: Калькулятор TPSA |
Учебные и справочные инструменты
| Инструмент | Что делает | Ссылка |
|---|---|---|
| Интерактивная периодическая таблица | Поиск по всем 118 элементам с конфигурацией, агрегатным состоянием и массой | Открыть: Интерактивная периодическая таблица |
| Инструмент для схем ТСХ | Рисование пластин ТСХ с дорожками, пятнами, подписями Rf и экспортом | Открыть: Инструмент для схем ТСХ |
| Курс MolDraw | Интерактивный курс химии | Открыть курс MolDraw |
| Справочные страницы молекул | Кофеин, аспирин, ибупрофен, глюкоза и другие | Открыть справочные страницы молекул |
| Руководства по реакциям | Альдольная конденсация, реакции Виттига, Гриньяра, Сузуки, Хека, Дильса–Альдера и другие | Открыть руководства по реакциям |
Рекомендуемые сценарии работы
Студентам и для занятий
- Рисование структур: редактор MolDraw
- Уравнивание реакций: уравнивание химических реакций
- Лабораторные расчёты: молярность, разбавление, выход продукта
- Отчёты по ТСХ: инструмент для схем ТСХ
- Периодическая таблица: интерактивная периодическая таблица
Исследования и хемоинформатика
- Очистка идентификаторов: конвертеры SMILES ↔ InChI ↔ InChIKey
- Поиск по реестрам: CAS в структуру, CID в SMILES
- Подготовка к докингу: SMILES в PDBQT, PDB в PDBQT
- Ранний отбор по ADME: Липински, LogP, TPSA
Вычислительная химия
- Координаты обратно в 2D: XYZ / Gaussian в 2D-структуру
- Координаты в SMILES: XYZ в SMILES
- 3D-экспорт: SMILES в 3D-структуру
Вопросы и ответы
Бесплатны ли инструменты MolDraw?
Да. Перечисленные здесь браузерные инструменты и калькуляторы бесплатны на moldraw.com.
Нужна ли учётная запись?
Для большинства инструментов учётная запись не нужна. Основной редактор и калькуляторы работают в браузере. Для некоторых функций сообщества нужно войти в систему.
Как быстрее всего найти инструмент?
Используйте химические инструменты или ищите в этом руководстве по типу входных данных (SMILES, название, формула, XYZ, CAS и т. д.).
Можно ли перепубликовать этот список на другом сайте?
Да, со ссылкой на MolDraw от Scidart Academy. Для публикации на внешних ресурсах в репозитории MolDraw также есть версия в формате Markdown.