MolDraw 所有免費化學工具完整指南
這是 MolDraw 所有免費化學工具的完整連結目錄,包括轉換工具、計算器、繪圖工具與教學資源。你可以把它當作快速參考,也可以在註明出處為 MolDraw 的前提下分享到其他網站。
快速指南:如何使用 MolDraw 工具
MolDraw 是免費的瀏覽器化學平台,大多數工作流程都不需要安裝軟體。
- 繪製或編輯結構:開啟 MolDraw 編輯器,進行 2D 繪圖、3D 檢視、SMILES 匯出與下載。
- 瀏覽所有工具:從化學工具首頁或免費化學工具目錄開始。
- 選擇符合輸入的工具:SMILES、名稱、分子式、XYZ 座標、CAS 號碼、MOL/SDF 資料區塊等。
- 轉換或計算:在瀏覽器中執行工具,再複製結果或下載檔案。
- 回到編輯器:許多工具都會連回 MolDraw,方便你進一步編輯結構。
最適用於:需要快速化學工具、又不想安裝桌面軟體的學生、教師、實驗室團隊與研究人員。
繪圖與結構工具
| 工具 | 功能 | 連結 |
|---|---|---|
| MolDraw 編輯器 | 2D 繪圖、3D 檢視、名稱搜尋、PNG/SVG/SDF/XYZ/PDB 匯出 | 開啟 MolDraw 編輯器 |
| 化學反應式繪製工具 | 繪製包含反應物、產物、箭頭、試劑和條件的反應式 | 開啟化學反應式繪製工具 |
| SMILES 轉結構式 | 貼上 SMILES,顯示 2D 結構 | 開啟 SMILES 轉結構式 |
| 結構轉 SMILES | 在 2D 編輯器中繪圖,即時得到 SMILES | 開啟結構轉 SMILES |
| SMILES 轉 3D 結構 | 3D 檢視,並可下載 PNG、SDF、XYZ、PDB、MOL、OBJ、X3D | 開啟 SMILES 轉 3D 結構 |
| XYZ / Gaussian 轉 2D | 將 XYZ、.gjf 或 .com 座標轉換為推斷出的 2D 結構 | 開啟 XYZ / Gaussian 轉 2D |
| XYZ 轉 SMILES | 將 XYZ 座標轉換為 SMILES,並可編輯整理 | 開啟 XYZ 轉 SMILES |
| 名稱轉結構式 | 由名稱得到 2D 結構、SMILES、分子式、分子量和 PubChem CID | 開啟名稱轉結構式 |
| 分子式轉結構式 | 搜尋 C9H8O4 等分子式並比較 PubChem 候選結構 | 開啟分子式轉結構式 |
| 路易斯結構產生器 | 由分子式與電荷建立路易斯電子點結構 | 開啟路易斯結構產生器 |
| 蛋白質檢視器 | 依 PDB ID 或檔案載入蛋白質;可匯出多種格式 | 開啟蛋白質檢視器 |
SMILES、MOL、SDF、PDB 及檔案轉換器
| 工具 | 功能 | 連結 |
|---|---|---|
| SMILES 轉 MOL | 將 SMILES 轉換為 MOL,用於編輯器/電子實驗紀錄簿(ELN)流程 | 開啟 SMILES 轉 MOL |
| SMILES 轉 SDF | 由 SMILES 產生 SDF,用於資料集 | 開啟 SMILES 轉 SDF |
| SMILES 轉 MOL2 | 將 SMILES 轉換為 MOL2,用於對接前準備 | 開啟 SMILES 轉 MOL2 |
| SMILES 轉 PDB | 將 SMILES 轉換為可下載的 3D PDB | 開啟 SMILES 轉 PDB |
| SMILES 轉 PDBQT | 將 SMILES 轉換為 PDBQT,用於分子對接 | 開啟 SMILES 轉 PDBQT |
| MOL 轉 SMILES | 將 MOL/SDF 資料區塊轉換為 SMILES | 開啟 MOL 轉 SMILES |
| MOL2 轉 SMILES | 將 MOL2 配體資料區塊轉換為 SMILES | 開啟 MOL2 轉 SMILES |
| PDB 轉 SMILES | 把配體 PDB 文字轉換為 SMILES | 開啟 PDB 轉 SMILES |
| PDB 轉 PDBQT | 將 PDB 座標轉換為 PDBQT | 開啟 PDB 轉 PDBQT |
| SDF 轉 InChI | 將 SDF/MOL 資料區塊轉換為 InChI | 開啟 SDF 轉 InChI |
| SDF 轉 InChIKey | 由 SDF/MOL 資料區塊產生 InChIKey | 開啟 SDF 轉 InChIKey |
| MOL 轉 InChI | 將 MOL/SDF 轉換為 InChI | 開啟 MOL 轉 InChI |
| MOL 轉 InChIKey | 將 MOL/SDF 轉換為 InChIKey | 開啟 MOL 轉 InChIKey |
InChI、InChIKey、IUPAC、CID 和 CAS 工具
| 工具 | 功能 | 連結 |
|---|---|---|
| SMILES 轉 InChI | 由 SMILES 產生 InChI | 開啟 SMILES 轉 InChI |
| SMILES 轉 InChIKey | 將 SMILES 轉換為 InChIKey | 開啟 SMILES 轉 InChIKey |
| InChI 轉 SMILES | 將 InChI 轉換回 SMILES | 開啟 InChI 轉 SMILES |
| InChIKey 轉 SMILES | 由 InChIKey 解析出 SMILES | 開啟 InChIKey 轉 SMILES |
| InChI 轉 InChIKey | 把完整 InChI 轉換為 InChIKey | 開啟 InChI 轉 InChIKey |
| InChIKey 轉 InChI | 由 InChIKey 解析出完整 InChI | 開啟 InChIKey 轉 InChI |
| IUPAC 名稱轉 SMILES | 把系統命名轉換為 SMILES | 開啟 IUPAC 名稱轉 SMILES |
| SMILES 轉 IUPAC 名稱 | 由 SMILES 產生 IUPAC 名稱 | 開啟 SMILES 轉 IUPAC 名稱 |
| CID 轉 SMILES | 由 PubChem CID 解析出 SMILES | 開啟 CID 轉 SMILES |
| CAS 轉 SMILES | 將 CAS 號碼轉換為 SMILES 並附後設資料 | 開啟 CAS 轉 SMILES |
| CAS 轉結構式 | 查詢 CAS 號碼並顯示 2D 結構、SMILES 和 CID | 開啟 CAS 轉結構式 |
分子式、質量和光譜工具
| 工具 | 功能 | 連結 |
|---|---|---|
| 分子式與質量工具 | 分子式與質量工具的總覽頁 | 開啟分子式與質量工具 |
| 分子量計算器 | 分子量、莫耳質量、元素組成與質量百分組成 | 開啟分子量計算器 |
| SMILES 轉分子式 | 將 SMILES 轉換為分子式 | 開啟 SMILES 轉分子式 |
| SMILES 轉分子量 | 由 SMILES 計算分子量並附後設資料 | 開啟 SMILES 轉分子量 |
| 精確質量計算器 | 由分子式計算單一同位素精確質量 | 開啟精確質量計算器 |
| 質譜預測器 | 預測同位素分布和分子離子區 | 開啟質譜預測器 |
| 克數轉莫耳數計算器 | 利用莫耳質量進行克 ↔ 莫耳換算 | 開啟克數轉莫耳數計算器 |
實驗室、化學計量和溶液計算器
| 工具 | 功能 | 連結 |
|---|---|---|
| 莫耳濃度計算器 | 由質量、分子量與體積計算莫耳濃度 | 開啟莫耳濃度計算器 |
| 重量莫耳濃度計算器 | 由溶質的量與溶劑質量計算重量莫耳濃度 | 開啟重量莫耳濃度計算器 |
| 稀釋計算器 | 以 C1V1 = C2V2 計算儲備溶液與溶劑體積 | 開啟稀釋計算器 |
| 溶液配製計算器 | 依目標莫耳濃度與最終體積計算溶質質量 | 開啟溶液配製計算器 |
| 化學方程式平衡工具 | 利用預設範例與提示平衡化學方程式 | 開啟化學方程式平衡工具 |
| 限量試劑計算器 | 限量反應物、過量反應物、剩餘量與理論產量 | 開啟限量試劑計算器 |
| 產率計算器 | 產率、實際產量或理論產量 | 開啟產率計算器 |
| pH 計算器 | pH、pOH、強酸/強鹼、緩衝溶液與 pKa 輔助計算 | 開啟 pH 計算器 |
| pKa 計算器 | 由 pH 求 pKa、由 pKa 求 pH、韓德森-哈塞爾巴赫方程式 | 開啟 pKa 計算器 |
類藥性與藥物化學工具
| 工具 | 功能 | 連結 |
|---|---|---|
| Lipinski 規則計算器 | 五規則:由 SMILES 或名稱計算 MW、LogP、HBD、HBA | 開啟 Lipinski 規則計算器 |
| 類藥性計算器 | Lipinski + Veber 式類藥性評分 | 開啟類藥性計算器 |
| LogP 計算器 | 由 SMILES 或化合物名稱取得 PubChem XLogP | 開啟 LogP 計算器 |
| TPSA 計算器 | 由 SMILES 或名稱計算拓撲極性表面積 | 開啟 TPSA 計算器 |
教學與參考工具
| 工具 | 功能 | 連結 |
|---|---|---|
| 互動式週期表 | 搜尋全部 118 種元素,包含電子組態、物態與質量 | 開啟互動式週期表 |
| TLC 圖繪製工具 | 繪製含樣品道、斑點與 Rf 標示的 TLC 片並匯出 | 開啟 TLC 圖繪製工具 |
| MolDraw 課程 | 互動式化學課程 | 開啟 MolDraw 課程 |
| 分子參考頁面 | 咖啡因、阿斯匹靈、布洛芬、葡萄糖等 | 開啟分子參考頁面 |
| 反應指南頁面 | 羥醛縮合(Aldol)、Wittig、Grignard、Suzuki、Heck、Diels–Alder 等反應 | 開啟反應指南頁面 |
建議的工作流程
學生或課堂
研究或化學資訊學
- 識別碼整理:SMILES ↔ InChI ↔ InChIKey 轉換器
- 登錄號查詢:CAS 轉結構式、CID 轉 SMILES
- 對接前準備:SMILES 轉 PDBQT、PDB 轉 PDBQT
- 早期 ADME 篩選:Lipinski、LogP、TPSA
計算化學
- 座標轉回 2D:XYZ / Gaussian 轉 2D 結構
- 座標轉 SMILES:XYZ 轉 SMILES
- 3D 匯出:SMILES 轉 3D 結構
常見問題
MolDraw 工具免費嗎?
是的。這裡列出的瀏覽器工具與計算器,都可以在 moldraw.com 免費使用。
需要帳號嗎?
大多數工具都不需要帳號。主編輯器與計算器可以直接在瀏覽器中使用,部分社群功能需要登入。
找到工具最快的方法是什麼?
使用化學工具首頁,或在本指南中依輸入類型(SMILES、名稱、分子式、XYZ、CAS 等)尋找。
可以把這份清單轉載到其他網站嗎?
可以,但請註明出處為 Scidart Academy 的 MolDraw。MolDraw 程式碼儲存庫中也提供 Markdown 版本,方便對外發布。