無料のNMRビューア
概要:JCAMP-DX(.jdx、.dx)、CSV/TXT、Bruker 1rファイルをブラウザで開き、ズーム、ピーク検出、積分、基準合わせ、溶媒不純物の検出、PNGでのエクスポートができます。無料でWebブラウザ上で動作し、インストールは不要です。
1Hまたは13C NMRスペクトルを開き、拡大、ピーク検出、積分、基準合わせができます。さらに溶媒やグリースのピークを見つけて非表示にし、きれいな図を作れます。ファイルはお使いのデバイスから外に出ません。
またはここにドロップ。JCAMP-DX(.jdx、.dx)、CSVまたはTXT(ppm、強度)、Bruker(フォルダのzip、または1rとprocsファイルを一緒に)。
例は実際の溶媒・不純物のシフトを使ったシミュレーションスペクトルなので、「不純物を検出」ですぐに結果が表示されます。サンプル.jdxをダウンロード。
不純物を検出
ピーク
積分
基準(シフトの校正)
NMRビューアの使い方
- ファイルを開くか、例のボタンを押して試します。
- プロット上をドラッグしてズームします。「パン」を選ぶと左右にスライドできます。ダブルクリックでスペクトル全体を表示します。
- ピークは自動で検出されます。「しきい値」スライダーを動かすとピークの数を増減できます。「ピークを選択」を選ぶとクリックで追加できます。
- 「積分」を選び、ピークの上をドラッグします。「最初の積分値 =」に、そのピークが表すHの数を設定します。
- 「溶媒で基準合わせ」を押して、溶媒ピークを正しい値に合わせます。
- 溶媒を選んで「不純物を検出」を押します。結果のチェックを入れたり外したりすると、マークの表示が切り替わります。「除去」を押すとそのピークが非表示になります。
- レポート用にPNGを、他のプログラム用にCSVやJCAMP-DXをエクスポートできます。
不純物の表について
1Hと13Cのシフトは、Fulmer, Miller, Sherden, Gottlieb, Nudelman, Stoltz, Bercaw, Goldberg, "NMR Chemical Shifts of Trace Impurities: Common Laboratory Solvents, Organics, and Gases in Deuterated Solvents Relevant to the Organometallic Chemist", Organometallics 2010, 29, 2176-2179(doi:10.1021/om100106e)によります。これはGottlieb, Kotlyar, Nudelman, J. Org. Chem. 1997, 62, 7512を拡張したものです。表には12種類の重水素化溶媒中の約45種類の一般的な溶媒、試薬、グリース、気体が含まれています。
不純物の除去は表示上の編集です。その化合物のピークを横切る直線を描くだけです。不純物を除去したスペクトルを論文や学位論文の生データとして使わないでください。代わりに不純物を報告してください。
よくある質問
スペクトルはサーバーにアップロードされますか?
いいえ。ファイルはブラウザ内で読み込まれ、プロットされます。MolDrawを含め、どこにも何も送信されません。
どのファイル形式を開けますか?
JCAMP-DX(.jdx、.dx、圧縮(ASDF)データを含む)、ppmと強度の2列からなるCSVまたはTXTファイル、Brukerの処理済みデータ(実験フォルダのzip、または1rとprocsファイルを一緒に選択)です。
「不純物を検出」はどのように動作しますか?
重水素化溶媒を選びます。ツールはピークを調べ、Fulmerら(Organometallics 2010)の公表された表を使って、既知のシフトが許容範囲内にある一般的な実験室の溶媒や試薬を一覧表示します。
「除去」では何をしますか?
その不純物のピークを横切る直線のベースラインを、表示とエクスポートのためだけに描きます。ファイル自体は変更されません。プロットには「表示用に編集済み」と表示され、「元に戻す」または「すべて復元」でピークが戻ります。
MHzの設定が重要なのはなぜですか?
ピークはppm単位ですが、結合定数はHz単位です。60 MHzの磁石では7 Hzの三重線の幅は約0.23 ppmですが、600 MHzでは約0.023 ppmです。MHzの値はHzの表示にも使われます。
スペクトルの基準合わせはどうすればよいですか?
「溶媒で基準合わせ」を押すと残留溶媒ピークが文献値(CDCl3なら7.26 ppm)に合わせられます。「TMS = 0 ppm」を押すか、「基準」をクリックしてピークをクリックし、正しいppmを入力することもできます。
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