InChIKey→SMILES変換ツール
概要:InChIKey識別子をカノニカルSMILES文字列に変換します。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。
PubChem PUG RESTを使って、InChIKey識別子をカノニカルSMILESに変換します。
ここにSMILES出力が表示されます。
入力形式と出力形式
| 入力:InChIKey | 出力:SMILES | |
|---|---|---|
| 正式名称 | InChIKey | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| 含まれる情報 | Webやデータベースの検索用に作られた、InChIの27文字のハッシュ。照会用のデータベースがなければ構造に戻すことはできません。 | 原子、結合、環、電荷、立体化学を1行のテキストで表現。座標は含まない。 |
| ファイル・形式 | XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Zのようなテキスト | .smi またはプレーンテキスト |
ファイル形式の解説
InChIKeyは、データベースの照会やWeb検索によく使われる、ハッシュ化されたコンパクトな化学識別子です。それ自体は編集可能な構造表記ではありません。
SMILESは、編集可能な1行の構造文字列です。この変換ツールはInChIKeyを使って一致する化合物レコードを探し、SMILES表現を返します。
InChIKeyの照会はデータベースのレコードに依存するため、特殊な塩、混合物、立体異性体、一致しない化合物はうまく変換できないことがあります。
InChIKeyからSMILESを調べる理由
InChIKeyは短く検索しやすいため、多くのデータベース、特許、補足資料に登場します。化合物を描いたり修正したりするには構造形式が必要で、SMILESが最も便利です。このツールはキーに一致するレコードを探し、そのSMILESを返します。
使い方
- 完全なInChIKeyを貼り付けます(例:アスピリンなら
BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N)。 - 変換するとSMILESが得られます。この例では
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)Oです。 - SMILESをMolDrawかSMILESから構造式へに貼り付けて表示します。
FAQ
照会結果が空になることがあるのはなぜですか?キーは公開データベースに存在している必要があります。未公開や独自の化合物のキーは変換できません。最後の文字は重要ですか?はい。プロトン化状態を記録しているため、中性の酸と脱プロトン化した形では別のキーになります。立体異性体はどうなりますか?エナンチオマーは最初の14文字が同じで2番目のブロックが異なるため、正しい異性体を得るには完全なキーを使ってください。
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