SMILES→分子式変換ツール
概要:SMILES文字列を貼り付けると、分子式、分子量、IUPAC名、PubChem CID(存在する場合)が得られます。無料でWebブラウザ上で動作し、インストールは不要です。
SMILES文字列を貼り付けると、分子式とPubChemの関連メタデータが得られます。
要点:CCOやCC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)OなどのSMILESを貼り付けて、分子式に変換します。
ここに分子式が表示されます。
SMILESと分子式について
SMILESは分子内の原子のつながりをコンパクトな文字列で表します。分子式は分子中の原子数をまとめたもので、たとえばアスピリンはC9H8O4です。
- 分子式の出力は、レポート、精密質量の確認、組成計算に使えます。
- 分子式からg/molを求めたいときは分子量ツールを使います。
分子式の求め方
SMILESでは水素以外の原子(重原子)は明示されますが、ほとんどの水素は暗黙的です。各原子には通常の原子価を満たすだけの水素が付きます。このツールは明示された原子をすべて数え、暗黙の水素を加え、Hill方式の順序(炭素、水素、残りの元素はアルファベット順)で分子式を書きます。
計算例
酢酸エチルCCOC(=O)Cの場合:
- 炭素:4。酸素:2。
- 水素:CH3(3)+ CH2(2)+ エステルの炭素(0)+ CH3(3)= 8。
- 分子式:C4H8O2。
注意点
- 電荷:
CC(=O)[O-](酢酸イオン)はC2H3O2−となり、酢酸より水素が1つ少なくなります。 - 角かっこ内の原子:角かっこ内の原子には書かれた水素しか付かないため、
[CH2]はちょうど2個の水素をもつ炭素です。 - 塩:
[Na+].[Cl-]のようにドットで区切ったSMILESでは、すべての成分を合わせて計算します。
質量も必要ですか?SMILES→分子量や精密質量計算ツールを使ってください。
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