MOLからInChIKeyへの変換ツール
概要:MOLまたはSDFの構造ブロックを標準InChIKey識別子に変換します。無料でWebブラウザ上で動作し、ダウンロードは不要です。
MOLまたはSDFブロックを貼り付けて、標準InChIKeyに変換します。
ここにInChIKeyが表示されます。
入力形式と出力形式
| 入力:MOLファイル | 出力:InChIKey | |
|---|---|---|
| 正式名称 | MOLファイル(MDL Molfile) | InChIKey |
| 含まれる情報 | 1分子の2Dまたは3D座標つき原子リストと結合テーブル。 | InChIから作られる27文字のハッシュで、Web検索やデータベース検索用です。検索用データベースがなければ構造に戻すことはできません。 |
| ファイル・形式 | .mol | XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z のようなテキスト |
ファイル形式の解説
MOLは原子ブロックと結合ブロックをもつ構造ファイルです。描画した座標や編集可能な分子トポロジーを保持できます。
InChIKeyはInChIから生成される固定長のキーです。化合物コレクション全体での高速な検索、データベース照合、重複検出のために設計されています。
編集可能な構造ファイルが必要な場合はMOLを、検索や照合用のコンパクトな識別子が必要な場合はInChIKeyを使います。
InChIKeyを出力に選ぶべき場合
MOLファイルの構造をオンラインで探したい、スプレッドシートに登録したい、2つのファイルが同じ化合物を表しているか確認したい、といった場合には、InChIKeyが最も実用的な識別子です。固定長の文字列なのでデータベースの列にすっきり収まり、検索エンジンのクエリとしても使えます。
使い方
- 構造を.molファイルとして書き出すか開きます。
- 最初のヘッダー行から
M ENDまで、テキスト全体をコピーします。 - 貼り付けて変換し、27文字のキーをコピーします。
使用例
- 重複チェック:フォルダー内のMOLファイルのキーを生成して並べ替えます。キーが同じなら、原子の番号付けが異なっていても構造は同一です。
- 文献検索:キーを検索エンジンで検索すると、その化合物に言及したデータベースのエントリーや論文が見つかります。
- 立体異性体の比較:最初のブロックを比べると、2つの立体異性体が同じ骨格をもつかどうかがわかります。
完全な識別子も必要な場合はMOLからInChIへを、SMILESがある場合はSMILESからInChIKeyへを使ってください。
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