MolDraw › Химические инструменты › Просмотр масс-спектров

Бесплатный просмотр масс-спектров

Кратко: открывайте файлы JCAMP-DX, CSV, mzML или mzXML, подписывайте пики, накладывайте изотопное распределение формулы, SMILES или пептида, проверяйте аддукты, ошибку в ppm и нейтральные потери, экспортируйте PNG или CSV. Бесплатно, работает в браузере и не требует загрузки.

Откройте масс-спектр, подпишите пики и сравните его с изотопным распределением вашей формулы, SMILES или пептида. Проверьте аддукты, ошибку в ppm и нейтральные потери. Ваши файлы остаются на вашем устройстве.

или перетащите его сюда. JCAMP-DX (.jdx, .dx), CSV/TXT (m/z, интенсивность), mzML или mzXML (первый спектр).

Загрузить пример:

Примеры смоделированы, их можно свободно использовать. Скачать пример .jdx.

Формула, SMILES или пептид

Как пользоваться просмотрщиком масс-спектров

  1. Откройте свой файл или нажмите кнопку примера.
  2. Выберите «Линии» или «Профиль», увеличьте нужную область и отметьте «Базовый пик = 100%» для нормировки.
  3. Введите формулу, SMILES или пептид и выберите ион, например [M+H]+. Красные линии показывают теоретическое изотопное распределение.
  4. Нажмите на измеренный пик, чтобы получить ошибку в ppm. Таблица аддуктов показывает, какие распространённые ионы присутствуют.
  5. Читайте подписи нейтральных потерь между основными пиками.
  6. Экспортируйте PNG или CSV.

Как читать масс-спектр

Каждый пик — это ион при своём значении m/z (масса, делённая на заряд). Самый высокий пик — базовый пик, его интенсивность принимается за 100%. В спектрах ЭИ молекулярный ион M+• часто мал, и основную информацию несут фрагменты. В ESI видны в основном [M+H]+, [M+Na]+ или [M-H]-, а крупные молекулы, такие как пептиды, дают также ионы 2+ и 3+ с изотопными пиками через 0,5 или 0,33.

Изотопы: углерод-13 даёт пик на 1 выше M, около 1,1% на каждый атом углерода. Хлор и бром дают сильные пики на 2 выше M. Нейтральные потери между пиками, такие как −18 (H2O), −28 (CO), −44 (CO2) или −35 (Cl), показывают, какие группы отщепляются.

Часто задаваемые вопросы

Загружаются ли мои данные куда-нибудь?

Нет. Файлы читаются и отрисовываются только в вашем браузере.

Какие файлы можно открыть?

Масс-спектры JCAMP-DX (таблицы пиков и непрерывные данные), CSV или TXT со столбцами m/z и интенсивности, а также mzML или mzXML. Для mzML и mzXML показывается первый спектр. Сжатые (zlib) массивы поддерживаются в современных браузерах.

Чем отличаются моноизотопная, средняя и точная масса?

Моноизотопная масса рассчитывается по самому распространённому изотопу каждого элемента (12C, 1H, 35Cl). Средняя масса учитывает природную распространённость — именно её вы получаете при взвешивании. Точное m/z — это моноизотопная масса наблюдаемого иона с учётом добавленных или отщеплённых атомов и массы электрона.

Как проверить наличие хлора или брома?

Введите формулу и посмотрите на распределение. Один Cl даёт пик M+2 примерно в треть от M (3:1). Один Br даёт M и M+2 примерно равной высоты (1:1). Два Br дают 1:2:1. Красные линии показывают теорию поверх ваших данных.

Как рассчитывается ошибка в ppm?

ppm = (измеренное − теоретическое) / теоретическое × 1 000 000. Нажмите на пик, чтобы использовать его как измеренное значение. Для данных высокого разрешения хорошим совпадением считается отклонение в пределах примерно 5 ppm.

Что означают подписи нейтральных потерь?

Инструмент анализирует расстояния между основными пиками и называет распространённые небольшие нейтральные потери, такие как H2O, NH3, CO, CO2, CH3, HCl, Cl и Br. Изотопные пики пропускаются. При единичном разрешении CO и C2H4 неразличимы, поэтому могут быть указаны оба.

Откуда берутся изотопные данные?

Массы изотопов и их природная распространённость — общедоступные справочные значения IUPAC (CIAAW) и NIST. Распределение рассчитывается сочетанием изотопов всех атомов.

Последнее обновление: