Конвертер InChIKey в SMILES
Коротко: получайте канонические строки SMILES по идентификаторам InChIKey. Бесплатно, работает в браузере и не требует загрузки.
Получайте канонические SMILES по идентификаторам InChIKey через PubChem PUG REST.
Входной и выходной форматы
| Вход: InChIKey | Выход: SMILES | |
|---|---|---|
| Полное название | InChIKey | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Что содержит | 27-символьный хеш InChI, созданный для поиска в интернете и базах данных. Без базы данных для поиска его нельзя превратить обратно в структуру. | Атомы, связи, циклы, заряды и стереохимию в одной строке текста. Без координат. |
| Файл или форма | Текст вида XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z | .smi или обычный текст |
Описание форматов файлов
InChIKey — компактный хешированный химический идентификатор, который часто используется для поиска в базах данных и интернете. Сам по себе он не является редактируемой структурной нотацией.
SMILES — редактируемая однострочная запись структуры. Этот конвертер по InChIKey находит соответствующую запись соединения и возвращает её представление SMILES.
Поскольку поиск по InChIKey зависит от записей в базах данных, необычные соли, смеси, стереоизомеры или ненайденные соединения могут не распознаться корректно.
Зачем искать SMILES по InChIKey
InChIKey встречаются во многих базах данных, патентах и дополнительных материалах, потому что они короткие и удобны для поиска. Чтобы нарисовать или изменить соединение, нужен структурный формат, и SMILES — самый удобный. Этот инструмент находит запись, соответствующую ключу, и возвращает её SMILES.
Как пользоваться
- Вставьте полный InChIKey, например
BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-Nдля аспирина. - Выполните преобразование, чтобы получить SMILES, в данном случае
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O. - Вставьте SMILES в MolDraw или «SMILES в структуру», чтобы увидеть её.
Вопросы и ответы
Почему поиск иногда ничего не находит? Ключ должен существовать в открытой базе данных. Ключи неопубликованных или проприетарных соединений не распознаются. Важна ли последняя буква? Да. Она отражает состояние протонирования, поэтому у нейтральной кислоты и её депротонированной формы разные ключи. А стереоизомеры? У энантиомеров первые 14 символов совпадают, а второй блок различается, поэтому используйте полный ключ, чтобы получить нужный изомер.
Последнее обновление: