Конвертер MOL в SMILES
Коротко: вставьте содержимое MOL/SDF и преобразуйте его в SMILES онлайн. Бесплатно, работает в браузере и не требует установки.
Вставьте, загрузите или импортируйте из PubChem блок MOL/SDF, а затем преобразуйте его в SMILES. Инструмент сначала пробует преобразование через PubChem, а при необходимости переключается на NCI Cactus.
Вставьте содержимое MOL/SDF, загрузите файл или импортируйте 2D-запись SDF из PubChem.
Входной и выходной форматы
| Вход: файл MOL | Выход: SMILES | |
|---|---|---|
| Полное название | Файл MOL (MDL Molfile) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Что содержит | Список атомов с 2D- или 3D-координатами и таблица связей для одной молекулы. | Атомы, связи, циклы, заряды и стереохимия в одной строке текста. Без координат. |
| Файл или форма | .mol | .smi или обычный текст |
Объяснение форматов файлов
Файлы MOL и SDF хранят блоки атомов и связей, часто с 2D- или 3D-координатами. Они удобны для обмена редактируемыми структурами и записями данных о соединениях.
SMILES переводит эту структуру в компактную однострочную текстовую нотацию. Она удобна для поиска, идентификаторов, скриптов и веб-инструментов.
При преобразовании MOL или SDF в SMILES проверяйте стереохимию, заряды, соли и ароматичность. Часть координат и свойств из исходного файла в SMILES не сохранится.
Последнее обновление: