Конвертер MOL в InChIKey
Коротко: преобразуйте блоки структур MOL или SDF в стандартные идентификаторы InChIKey. Бесплатно, работает в браузере и не требует загрузки.
Вставьте блок MOL или SDF и преобразуйте его в стандартное значение InChIKey.
Входной и выходной форматы
| Вход: файл MOL | Выход: InChIKey | |
|---|---|---|
| Полное название | Файл MOL (MDL Molfile) | InChIKey |
| Что содержит | Список атомов с 2D- или 3D-координатами и таблица связей для одной молекулы. | 27-символьный хеш InChI, созданный для поиска в интернете и базах данных. Без базы данных для поиска его нельзя превратить обратно в структуру. |
| Файл или форма | .mol | Текст вида XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Описание форматов файлов
MOL — файл структуры с блоками атомов и связей. Он может сохранять нарисованные координаты и редактируемую топологию молекулы.
InChIKey — ключ фиксированной длины, получаемый из InChI. Он предназначен для быстрого поиска, сопоставления в базах данных и обнаружения дубликатов в химических коллекциях.
Используйте MOL, когда нужен редактируемый файл структуры. Используйте InChIKey, когда нужен компактный идентификатор для поиска или сопоставления.
Когда InChIKey — правильный выбор
Если у вас есть структура в виде файла MOL и вы хотите найти её в интернете, внести в таблицу или проверить, описывают ли два файла одно и то же соединение, InChIKey — самый практичный идентификатор. Это строка фиксированной длины, поэтому она аккуратно помещается в столбец базы данных и работает как поисковый запрос.
Как пользоваться
- Экспортируйте или откройте структуру в виде файла .mol.
- Скопируйте весь текст — от первой строки заголовка до
M END. - Вставьте и преобразуйте, затем скопируйте ключ из 27 символов.
Примеры использования
- Проверка дубликатов: получите ключи для папки файлов MOL и отсортируйте их; одинаковые ключи означают одинаковые структуры, даже если атомы пронумерованы по-разному.
- Поиск в литературе: введите ключ в поисковую систему, чтобы найти записи в базах данных и статьи, где упоминается соединение.
- Сравнение стереоизомеров: сравните первый блок, чтобы увидеть, имеют ли два стереоизомера общий скелет.
Нужен и полный идентификатор? Используйте MOL в InChI. У вас SMILES? Используйте SMILES в InChIKey.
Последнее обновление: