Конвертер названий IUPAC в SMILES
Кратко: преобразуйте систематические названия в SMILES или импортируйте соединения из PubChem по названию/CID. Инструмент бесплатный, работает в браузере и не требует загрузки.
Преобразуйте названия IUPAC или названия соединений из PubChem в SMILES. Удобно для перевода названий из литературы в строки структур. Названия вводите на английском языке.
Входной и выходной форматы
| Вход: название IUPAC | Выход: SMILES | |
|---|---|---|
| Полное название | Название IUPAC | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Что содержит | Систематическое химическое название, составленное по правилам номенклатуры IUPAC. | Атомы, связи, циклы, заряды и стереохимию в одной строке текста. Без координат. |
| Файл или форма | Текст | .smi или обычный текст |
Описание форматов файлов
Названия IUPAC — формальные химические названия, систематически описывающие структуру. Они полезны в публикациях и обучении, но длинные названия неудобно вставлять в программы.
SMILES — компактная строка структуры, используемая редакторами, базами данных, хемоинформатическими скриптами и конвертерами. Преобразование IUPAC в SMILES превращает название из литературы в машиночитаемую структуру.
Распознавание названий лучше всего работает для однозначных, известных названий на английском языке. Соли, смеси, стереохимия, тривиальные названия и варианты написания могут не дать результата или привести к другой записи.
Советы по преобразованию названий в SMILES
Систематические названия IUPAC точно кодируют структуру, но они длинные, и в них легко ошибиться. Преобразование названия в SMILES даёт компактную машиночитаемую структуру, которую можно вставить в редактор или таблицу.
Примеры
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid (аспирин) →
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid (L-аланин) →
C[C@@H](C(=O)O)N
Как получить хороший результат
- Копируйте названия точно, включая локанты, запятые, дефисы и скобки: 1,2-dichloroethane — не то же самое, что 1,1-dichloroethane.
- Включайте стереодескрипторы, например (R), (S), (E) или (Z), если нужен конкретный изомер; иначе стереохимия может остаться неопределённой.
- Тривиальные названия, например caffeine, тоже часто работают, но очень новые или редкие торговые названия могут не распознаться.
- Следите за типографскими символами из PDF, например особыми тире или штрихами, и заменяйте их обычными дефисами и апострофами.
Нужно обратное преобразование? Используйте SMILES в название IUPAC.
Последнее обновление: