Конвертер XYZ / Gaussian в 2D-структуру

Коротко: вставьте или загрузите XYZ, Gaussian .gjf, .com или текст с координатами и получите редактируемый холст 2D-структуры молекулы с определёнными связями. Бесплатно, работает в браузере и не требует загрузки.

Вставьте или загрузите XYZ, входной файл Gaussian или текст декартовых координат и получите редактируемый холст 2D-структуры с определёнными связями.

Быстрый ответ: инструмент считывает координаты атомов, определяет вероятные связи по ковалентным радиусам, проецирует 3D-геометрию в 2D, загружает результат во встроенный редактор и экспортирует SVG, PNG или определённый файл MOL.

Входные координаты

Готово. Вставьте координаты и выполните преобразование.

Редактируемая 2D-структура

Загрузка редактора...
Статический SVG-предпросмотр определённой структуры
Здесь появится предпросмотр 2D-структуры.

Блок MOL с определёнными связями

MOL output appears here.

Описание форматов файлов

XYZ хранит символы атомов и 3D-координаты, обычно без порядков связей, зарядов, ароматичности и стереохимии. Формат распространён в вычислительной и квантовой химии.

Входные файлы Gaussian, такие как .gjf и .com, часто содержат строку заряда/мультиплетности, за которой следуют декартовы координаты. Этот инструмент по возможности извлекает такие блоки координат.

Поскольку файлы координат XYZ и Gaussian обычно не хранят порядок связей, результат — приближённая 2D-структура. Исправьте определённые связи на встроенном 2D-холсте перед публикацией, докингом или дальнейшей хемоинформатической обработкой.

Последнее обновление: