MolDraw › Ferramentas de química › Visualizador de Modelos Moleculares 3D
Visualizador de modelos moleculares 3D
Em resumo: Visualizador 3D de moléculas: busque qualquer molécula por nome, SMILES ou CID do PubChem e gire um modelo molecular de bolas e varetas, preenchimento espacial, varetas ou arame com cores CPK. É gratuito, funciona no seu navegador e não precisa de download.
Consulte qualquer molécula por nome, SMILES ou CID do PubChem e explore-a como um modelo 3D interativo, como um kit virtual de modelos moleculares. Você pode alternar entre bolas e varetas, preenchimento espacial, varetas e arame, ligar ou desligar rótulos e hidrogênios e salvar um PNG.
Arraste para girar, faça pinça ou role para ampliar, arraste com dois dedos para mover.
SMILES:
Estilos de modelos moleculares explicados
| Modelo | O que mostra | Melhor para |
|---|---|---|
| Bolas e varetas | Átomos como pequenas esferas, ligações como varetas | Ângulos de ligação, geometria e conectividade (kits de modelos moleculares da sala de aula) |
| Preenchimento espacial (CPK) | Átomos com seus raios de van der Waals | Tamanho e forma reais, volume estérico, como as moléculas se empacotam |
| Varetas | Só ligações, coloridas por átomo | Moléculas maiores, conformações |
| Arame | Linhas finas para as ligações | Estruturas grandes, rotação rápida |
Cores CPK
Os átomos são coloridos com o esquema padrão CPK (Jmol): carbono cinza, hidrogênio branco, oxigênio vermelho, nitrogênio azul, enxofre amarelo, fósforo laranja, cloro verde, bromo vermelho-escuro e iodo roxo.
As coordenadas 3D vêm dos confôrmeros calculados pelo PubChem, renderizados com 3Dmol.js. Para seu próprio SMILES com exportação em SDF, PDB ou XYZ, use o conversor de SMILES em estrutura 3D. Para proteínas e entradas do PDB, use o visualizador de proteínas.
Desenhando estruturas para suas anotações? O MolDraw é um editor de estruturas químicas online e gratuito para moléculas, reações e diagramas de laboratório.
Abrir o editor MolDrawPerguntas frequentes
O que é um modelo de bolas e varetas?
Um modelo de bolas e varetas mostra os átomos como esferas coloridas e as ligações como varetas. Ele facilita ver os ângulos de ligação e a geometria molecular, por exemplo, a angulação de 104,5° da água ou a forma tetraédrica do metano.
Qual é a diferença entre os modelos de bolas e varetas e de preenchimento espacial?
O modelo de bolas e varetas reduz os átomos para mostrar as ligações e os ângulos. Um modelo de preenchimento espacial (CPK) desenha cada átomo com seu raio de van der Waals, então mostra o tamanho e a forma reais da molécula, mas esconde as ligações.
O que significam as cores de um modelo molecular?
A maioria dos modelos usa as cores CPK: carbono cinza ou preto, hidrogênio branco, oxigênio vermelho, nitrogênio azul, enxofre amarelo, cloro verde e fósforo laranja.
Como ver uma molécula em 3D?
Digite o nome dela em inglês (ex.: caffeine), uma string SMILES ou um CID do PubChem e clique em Mostrar modelo 3D. Arraste para girar, faça pinça para ampliar e alterne entre bolas e varetas, preenchimento espacial, varetas e arame.
De onde vêm as estruturas 3D?
Dos confôrmeros 3D calculados pelo PubChem. Alguns sais, complexos metálicos e moléculas muito grandes não têm confôrmero 3D, então é mostrado um desenho 2D no lugar.
Posso montar minha própria molécula?
Sim. Use a ferramenta Monte uma Molécula para juntar átomos como em um kit, ou desenhe qualquer estrutura no editor MolDraw e veja-a em 3D.
Ferramentas de química relacionadas
Última atualização: