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3D-Molekülmodell-Viewer
Kurz gesagt: 3D-Molekülviewer: Suche jedes Molekül nach Name, SMILES oder PubChem-CID und drehe ein Kugel-Stab-, Kalotten-, Stab- oder Drahtmodell in CPK-Farben. Er ist kostenlos, läuft im Webbrowser und braucht keinen Download.
Suche ein beliebiges Molekül nach Name, SMILES oder PubChem-CID und erkunde es als interaktives 3D-Modell – wie ein virtueller Molekülbaukasten. Du kannst zwischen Kugel-Stab-, Kalotten-, Stab- und Drahtmodell wechseln, Beschriftungen und Wasserstoffatome ein- oder ausblenden und ein PNG speichern.
Ziehen zum Drehen, mit zwei Fingern oder Mausrad zoomen, mit zwei Fingern ziehen zum Verschieben.
SMILES:
Molekülmodelltypen erklärt
| Modell | Was es zeigt | Am besten für |
|---|---|---|
| Kugel-Stab-Modell | Atome als kleine Kugeln, Bindungen als Stäbe | Bindungswinkel, Geometrie und Konnektivität (Molekülbaukästen im Unterricht) |
| Kalottenmodell (CPK) | Atome mit ihren Van-der-Waals-Radien | Echte Größe und Form, sterischer Anspruch, Packung von Molekülen |
| Stab | Nur Bindungen, nach Atom eingefärbt | Größere Moleküle, Konformationen |
| Draht | Dünne Linien für Bindungen | Große Strukturen, schnelles Drehen |
CPK-Farben
Die Atome sind nach dem Standard-CPK-Schema (Jmol) eingefärbt: Kohlenstoff grau, Wasserstoff weiß, Sauerstoff rot, Stickstoff blau, Schwefel gelb, Phosphor orange, Chlor grün, Brom dunkelrot und Iod violett.
Die 3D-Koordinaten stammen aus den berechneten Konformeren von PubChem und werden mit 3Dmol.js dargestellt. Für eigene SMILES mit Export als SDF, PDB oder XYZ verwende den SMILES-in-3D-Struktur-Konverter. Für Proteine und PDB-Einträge verwende den Protein-Viewer.
Du zeichnest Strukturen für deine Notizen? MolDraw ist ein kostenloser Online-Editor für chemische Strukturen, Reaktionen und Laborskizzen.
MolDraw-Editor öffnenHäufig gestellte Fragen
Was ist ein Kugel-Stab-Modell?
Ein Kugel-Stab-Modell zeigt Atome als farbige Kugeln und Bindungen als Stäbe. So sind Bindungswinkel und Molekülgeometrie leicht zu erkennen, etwa der Winkel von 104,5° beim Wasser oder die tetraedrische Form von Methan.
Was ist der Unterschied zwischen Kugel-Stab- und Kalottenmodell?
Beim Kugel-Stab-Modell werden die Atome verkleinert, um Bindungen und Winkel zu zeigen. Ein Kalottenmodell (CPK) zeichnet jedes Atom mit seinem Van-der-Waals-Radius; es zeigt also die echte Größe und Form des Moleküls, verdeckt aber die Bindungen.
Was bedeuten die Farben in einem Molekülmodell?
Die meisten Modelle verwenden CPK-Farben: Kohlenstoff grau oder schwarz, Wasserstoff weiß, Sauerstoff rot, Stickstoff blau, Schwefel gelb, Chlor grün und Phosphor orange.
Wie sehe ich ein Molekül in 3D an?
Gib seinen (englischen) Namen (z. B. caffeine), einen SMILES-String oder eine PubChem-CID ein und klicke auf „3D-Modell anzeigen“. Ziehe zum Drehen, zoome mit zwei Fingern und wechsle zwischen Kugel-Stab-, Kalotten-, Stab- und Drahtmodell.
Woher stammen die 3D-Strukturen?
Aus den berechneten 3D-Konformeren von PubChem. Für manche Salze, Metallkomplexe und sehr große Moleküle gibt es kein 3D-Konformer; dann wird stattdessen eine 2D-Darstellung gezeigt.
Kann ich mein eigenes Molekül bauen?
Ja. Setze mit dem Tool „Molekül bauen“ Atome wie in einem Baukasten zusammen oder zeichne eine beliebige Struktur im MolDraw-Editor und sieh sie dir in 3D an.
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