MolDraw › Kimya araçları › 3B Molekül Modeli Görüntüleyici
3B Molekül Modeli Görüntüleyici
Kısaca: 3B molekül görüntüleyici: herhangi bir molekülü ad, SMILES veya PubChem CID ile arayın; CPK renkli top-çubuk, boşluk doldurmalı, çubuk veya tel kafes molekül modelini döndürün. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
Herhangi bir molekülü ad, SMILES veya PubChem CID ile bulun ve sanal bir molekül model seti gibi etkileşimli 3B model olarak inceleyin. Top-çubuk, boşluk doldurmalı, çubuk ve tel kafes arasında geçiş yapabilir, etiketleri ve hidrojenleri açıp kapatabilir ve PNG olarak kaydedebilirsiniz.
Döndürmek için sürükleyin, yakınlaştırmak için sıkıştırın veya kaydırın, taşımak için iki parmakla sürükleyin.
SMILES:
Molekül modeli stilleri
| Model | Ne gösterir | En uygun olduğu kullanım |
|---|---|---|
| Top-çubuk | Atomlar küçük küreler, bağlar çubuklar olarak | Bağ açıları, geometri ve bağlantılar (sınıf molekül model setleri) |
| Boşluk doldurmalı (CPK) | Atomlar van der Waals yarıçaplarında | Gerçek boyut ve şekil, sterik hacim, moleküllerin nasıl istiflendiği |
| Çubuk | Yalnızca bağlar, atoma göre renklendirilmiş | Daha büyük moleküller, konformasyonlar |
| Tel kafes | Bağlar için ince çizgiler | Büyük yapılar, hızlı döndürme |
CPK renkleri
Atomlar standart CPK (Jmol) şemasıyla renklendirilir: karbon gri, hidrojen beyaz, oksijen kırmızı, azot mavi, kükürt sarı, fosfor turuncu, klor yeşil, brom koyu kırmızı ve iyot mor.
3B koordinatlar PubChem'in hesaplanmış konformerlerinden gelir ve 3Dmol.js ile görüntülenir. Kendi SMILES’ınızı SDF, PDB veya XYZ olarak dışa aktarmak için SMILES’tan 3B yapıya dönüştürücüyü kullanın. Proteinler ve PDB kayıtları için protein görüntüleyiciyi kullanın.
Notlarınız için yapı mı çiziyorsunuz? MolDraw; moleküller, tepkimeler ve laboratuvar diyagramları için ücretsiz bir çevrimiçi kimyasal yapı editörüdür.
MolDraw editörünü açSık sorulan sorular
Top-çubuk modeli nedir?
Top-çubuk modeli atomları renkli küreler, bağları çubuklar olarak gösterir. Bağ açılarını ve molekül geometrisini, örneğin suyun 104,5°'lik açısını veya metanın düzgün dörtyüzlü şeklini görmeyi kolaylaştırır.
Top-çubuk ve boşluk doldurmalı modeller arasındaki fark nedir?
Top-çubuk modeli bağları ve açıları göstermek için atomları küçültür. Boşluk doldurmalı (CPK) model her atomu van der Waals yarıçapında çizer; böylece molekülün gerçek boyutunu ve şeklini gösterir ancak bağları gizler.
Molekül modelindeki renkler ne anlama gelir?
Çoğu model CPK renklerini kullanır: karbon gri veya siyah, hidrojen beyaz, oksijen kırmızı, azot mavi, kükürt sarı, klor yeşil ve fosfor turuncudur.
Bir molekülü 3B olarak nasıl görüntülerim?
Adını (örn. caffeine), bir SMILES dizesini veya PubChem CID’sini yazın ve 3B modeli göster’e basın. Döndürmek için sürükleyin, yakınlaştırmak için iki parmakla sıkıştırın ve top-çubuk, boşluk doldurmalı, çubuk ve tel kafes arasında geçiş yapın.
3B yapılar nereden geliyor?
PubChem'in hesaplanmış 3B konformerlerinden. Bazı tuzlar, metal kompleksleri ve çok büyük moleküllerin 3B konformeri yoktur; bu durumda bunun yerine 2B bir düzen gösterilir.
Kendi molekülümü oluşturabilir miyim?
Evet. Atomları model seti gibi birleştirmek için Molekül Oluştur aracını kullanın veya MolDraw editöründe herhangi bir yapıyı çizip 3B olarak görüntüleyin.
İlgili kimya araçları
Son güncelleme: