MolDraw › أدوات الكيمياء › عارض النماذج الجزيئية ثلاثية الأبعاد
عارض النماذج الجزيئية ثلاثية الأبعاد
باختصار: عارض جزيئات ثلاثي الأبعاد: ابحث عن أي جزيء بالاسم أو SMILES أو PubChem CID، ودوّر نموذجًا جزيئيًا بالكرة والعصا أو ملء الفراغ أو العصي أو الإطار السلكي بألوان CPK. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب ولا تحتاج إلى تنزيل.
ابحث عن أي جزيء بالاسم أو SMILES أو PubChem CID واستكشفه نموذجًا تفاعليًا ثلاثي الأبعاد، كعُدّة نماذج جزيئية افتراضية. يمكنك التبديل بين الكرة والعصا وملء الفراغ والعصي والإطار السلكي، وإظهار التسميات وذرات الهيدروجين أو إخفاؤها، وحفظ صورة PNG.
اسحب للتدوير، وقرّب بإصبعين أو بعجلة الفأرة للتكبير، واسحب بإصبعين للتحريك.
SMILES:
شرح أنماط النماذج الجزيئية
| النموذج | ما يُظهره | الأنسب لـ |
|---|---|---|
| الكرة والعصا | الذرات كرات صغيرة والروابط عصيّ | زوايا الروابط والشكل الهندسي والترابط (كعُدد النماذج الجزيئية في الصف) |
| ملء الفراغ (CPK) | الذرات بأنصاف أقطار فان دير فالس | الحجم والشكل الحقيقيان، والإعاقة الفراغية، وكيفية تراصّ الجزيئات |
| عصي | الروابط فقط، ملونة حسب الذرة | الجزيئات الأكبر والهيئات |
| إطار سلكي | خطوط رفيعة للروابط | البنى الكبيرة والتدوير السريع |
ألوان CPK
تُلوَّن الذرات بنظام CPK (Jmol) القياسي: الكربون رمادي، والهيدروجين أبيض، والأكسجين أحمر، والنيتروجين أزرق، والكبريت أصفر، والفوسفور برتقالي، والكلور أخضر، والبروم أحمر داكن، واليود بنفسجي.
تأتي الإحداثيات ثلاثية الأبعاد من الهيئات المحسوبة في PubChem، وتُعرض بمكتبة 3Dmol.js. ولـ SMILES الخاص بك مع التصدير إلى SDF أو PDB أو XYZ، استخدم محوّل SMILES إلى بنية ثلاثية الأبعاد. وللبروتينات ومدخلات PDB، استخدم عارض البروتينات.
ترسم بنى لملاحظاتك؟ MolDraw محرر مجاني عبر الإنترنت للبنى الكيميائية، للجزيئات والتفاعلات ومخططات المختبر.
افتح محرر MolDrawالأسئلة الشائعة
ما نموذج الكرة والعصا؟
يُظهر نموذج الكرة والعصا الذرات كرات ملونة والروابط عصيًّا. ويسهّل رؤية زوايا الروابط والشكل الهندسي للجزيء، مثل انحناء الماء بزاوية 104.5° أو الشكل الرباعي الأوجه للميثان.
ما الفرق بين نموذج الكرة والعصا ونموذج ملء الفراغ؟
يصغّر نموذج الكرة والعصا الذرات لإظهار الروابط والزوايا. أما نموذج ملء الفراغ (CPK) فيرسم كل ذرة بنصف قطر فان دير فالس، فيُظهر الحجم والشكل الحقيقيين للجزيء لكنه يخفي الروابط.
ماذا تعني الألوان في النموذج الجزيئي؟
تستخدم معظم النماذج ألوان CPK: الكربون رمادي أو أسود، والهيدروجين أبيض، والأكسجين أحمر، والنيتروجين أزرق، والكبريت أصفر، والكلور أخضر، والفوسفور برتقالي.
كيف أعرض جزيئًا بثلاثة أبعاد؟
اكتب اسمه بالإنجليزية (مثل caffeine) أو سلسلة SMILES أو رقم PubChem CID واضغط «اعرض النموذج ثلاثي الأبعاد». اسحب للتدوير، وقرّب بإصبعين للتكبير، وبدّل بين الكرة والعصا وملء الفراغ والعصي والإطار السلكي.
من أين تأتي البنى ثلاثية الأبعاد؟
من الهيئات ثلاثية الأبعاد المحسوبة في PubChem. وبعض الأملاح والمعقدات الفلزية والجزيئات الكبيرة جدًا ليس لها هيئة ثلاثية الأبعاد، فيُعرض بدلًا منها تخطيط ثنائي الأبعاد.
هل يمكنني بناء جزيئي الخاص؟
نعم. استخدم أداة «ابنِ جزيئًا» لتجميع الذرات كما في عُدّة النماذج، أو ارسم أي بنية في محرر MolDraw واعرضها بثلاثة أبعاد.
أدوات كيمياء ذات صلة
آخر تحديث: