MolDraw › เครื่องมือเคมี › โปรแกรมดูแบบจำลองโมเลกุล 3 มิติ

โปรแกรมดูแบบจำลองโมเลกุล 3 มิติ

สรุปสั้น ๆ: โปรแกรมดูโมเลกุล 3 มิติ: ค้นหาโมเลกุลใดก็ได้ด้วยชื่อ SMILES หรือ PubChem CID แล้วหมุนแบบจำลองโมเลกุลแบบลูกบอลและแท่ง เติมเต็มที่ว่าง แท่ง หรือโครงลวด พร้อมสี CPK ใช้งานฟรี ทำงานในเว็บเบราว์เซอร์ และไม่ต้องดาวน์โหลด

ค้นหาโมเลกุลใดก็ได้ด้วยชื่อ SMILES หรือ PubChem CID แล้วสำรวจเป็นแบบจำลอง 3 มิติแบบโต้ตอบได้ เหมือนชุดแบบจำลองโมเลกุลเสมือน คุณสลับระหว่างแบบลูกบอลและแท่ง เติมเต็มที่ว่าง แท่ง และโครงลวดได้ เปิดหรือปิดป้ายกำกับและไฮโดรเจน และบันทึกเป็น PNG

คำตอบโดยย่อ: พิมพ์ชื่อโมเลกุลเป็นภาษาอังกฤษ เช่น caffeine แล้วลากเพื่อหมุน แบบลูกบอลและแท่งแสดงพันธะและมุม แบบเติมเต็มที่ว่างแสดงขนาดและรูปร่างจริง และอะตอมใช้สี CPK (C สีเทา, H สีขาว, O สีแดง, N สีน้ำเงิน)

ลากเพื่อหมุน ใช้สองนิ้วหรือเลื่อนล้อเมาส์เพื่อซูม ลากสองนิ้วเพื่อเลื่อน

SMILES:

อธิบายรูปแบบแบบจำลองโมเลกุล

แบบจำลองสิ่งที่แสดงเหมาะสำหรับ
ลูกบอลและแท่งอะตอมเป็นทรงกลมเล็ก พันธะเป็นแท่งมุมพันธะ รูปร่าง และการเชื่อมต่อ (ชุดแบบจำลองโมเลกุลในห้องเรียน)
เติมเต็มที่ว่าง (CPK)อะตอมตามรัศมีแวนเดอร์วาลส์ขนาดและรูปร่างจริง ความเกะกะเชิงสเตอริก การจัดเรียงตัวของโมเลกุล
แท่งแสดงเฉพาะพันธะ ใช้สีตามอะตอมโมเลกุลขนาดใหญ่ คอนฟอร์เมชัน
โครงลวดเส้นบางแทนพันธะโครงสร้างขนาดใหญ่ หมุนได้เร็ว

สี CPK

อะตอมใช้สีตามแบบ CPK (Jmol) มาตรฐาน: คาร์บอนสีเทา ไฮโดรเจนสีขาว ออกซิเจนสีแดง ไนโตรเจนสีน้ำเงิน กำมะถันสีเหลือง ฟอสฟอรัสสีส้ม คลอรีนสีเขียว โบรมีนสีแดงเข้ม และไอโอดีนสีม่วง

พิกัด 3 มิติมาจากคอนฟอร์เมอร์ที่คำนวณโดย PubChem แสดงผลด้วย 3Dmol.js สำหรับ SMILES ของคุณเองพร้อมส่งออกเป็น SDF, PDB หรือ XYZ ใช้เครื่องมือแปลง SMILES เป็นโครงสร้าง 3 มิติ สำหรับโปรตีนและรายการ PDB ใช้โปรแกรมดูโปรตีน

กำลังวาดโครงสร้างสำหรับโน้ตอยู่หรือเปล่า? MolDraw คือตัวแก้ไขโครงสร้างเคมีออนไลน์ฟรีสำหรับโมเลกุล ปฏิกิริยา และแผนภาพในห้องปฏิบัติการ

เปิดตัวแก้ไข MolDraw

คำถามที่พบบ่อย

แบบจำลองลูกบอลและแท่ง (ball-and-stick) คืออะไร?

แบบจำลองลูกบอลและแท่งแสดงอะตอมเป็นทรงกลมสีและพันธะเป็นแท่ง ทำให้เห็นมุมพันธะและรูปร่างโมเลกุลได้ง่าย เช่น มุมงอ 104.5° ของน้ำ หรือรูปทรงสี่หน้าของมีเทน

แบบจำลองลูกบอลและแท่งกับแบบเติมเต็มที่ว่างต่างกันอย่างไร?

แบบลูกบอลและแท่งย่อขนาดอะตอมเพื่อแสดงพันธะและมุม แบบจำลองเติมเต็มที่ว่าง (CPK) วาดแต่ละอะตอมตามรัศมีแวนเดอร์วาลส์ จึงแสดงขนาดและรูปร่างจริงของโมเลกุล แต่ซ่อนพันธะไว้

สีในแบบจำลองโมเลกุลหมายถึงอะไร?

แบบจำลองส่วนใหญ่ใช้สี CPK: คาร์บอนสีเทาหรือดำ ไฮโดรเจนสีขาว ออกซิเจนสีแดง ไนโตรเจนสีน้ำเงิน กำมะถันสีเหลือง คลอรีนสีเขียว และฟอสฟอรัสสีส้ม

จะดูโมเลกุลแบบ 3 มิติได้อย่างไร?

พิมพ์ชื่อ (ภาษาอังกฤษ เช่น caffeine) สตริง SMILES หรือ PubChem CID แล้วกด แสดงแบบจำลอง 3 มิติ ลากเพื่อหมุน ใช้สองนิ้วเพื่อซูม และสลับระหว่างแบบลูกบอลและแท่ง เติมเต็มที่ว่าง แท่ง และโครงลวด

โครงสร้าง 3 มิติมาจากไหน?

มาจากคอนฟอร์เมอร์ 3 มิติที่คำนวณโดย PubChem เกลือ สารเชิงซ้อนของโลหะ และโมเลกุลขนาดใหญ่มากบางชนิดไม่มีคอนฟอร์เมอร์ 3 มิติ จึงแสดงเป็นภาพ 2 มิติแทน

สร้างโมเลกุลเองได้หรือไม่?

ได้ ใช้เครื่องมือสร้างโมเลกุลเพื่อประกอบอะตอมเหมือนชุดแบบจำลอง หรือวาดโครงสร้างใดก็ได้ในตัวแก้ไข MolDraw แล้วดูแบบ 3 มิติ

เครื่องมือเคมีที่เกี่ยวข้อง

อัปเดตล่าสุด: