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Visor de modelos moleculares 3D
En resumen: visor de moléculas 3D: busca cualquier molécula por nombre, SMILES o CID de PubChem y gira un modelo molecular de bolas y varillas, compacto, de varillas o de alambre con colores CPK. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descarga.
Busca cualquier molécula por nombre, SMILES o CID de PubChem y explórala como un modelo 3D interactivo, como un kit de modelos moleculares virtual. Puedes cambiar entre bolas y varillas, compacto, varillas y alambre, mostrar u ocultar etiquetas e hidrógenos, y guardar un PNG.
Arrastra para girar, pellizca o usa la rueda para hacer zoom, arrastra con dos dedos para mover.
SMILES:
Estilos de modelos moleculares
| Modelo | Qué muestra | Ideal para |
|---|---|---|
| Bolas y varillas | Átomos como esferas pequeñas, enlaces como varillas | Ángulos de enlace, geometría y conectividad (kits de modelos moleculares de clase) |
| Compacto (CPK) | Átomos con sus radios de van der Waals | Tamaño y forma reales, volumen estérico, cómo se empaquetan las moléculas |
| Varillas | Solo enlaces, coloreados por átomo | Moléculas más grandes, conformaciones |
| Alambre | Líneas finas para los enlaces | Estructuras grandes, rotación rápida |
Colores CPK
Los átomos se colorean con el esquema CPK (Jmol) estándar: carbono gris, hidrógeno blanco, oxígeno rojo, nitrógeno azul, azufre amarillo, fósforo naranja, cloro verde, bromo rojo oscuro y yodo violeta.
Las coordenadas 3D provienen de los confórmeros calculados de PubChem, representados con 3Dmol.js. Para tus propios SMILES con exportación a SDF, PDB o XYZ, usa el convertidor de SMILES a estructura 3D. Para proteínas y entradas del PDB, usa el visor de proteínas.
¿Dibujas estructuras para tus apuntes? MolDraw es un editor de estructuras químicas gratuito y en línea para moléculas, reacciones y diagramas de laboratorio.
Abrir el editor MolDrawPreguntas frecuentes
¿Qué es un modelo de bolas y varillas?
Un modelo de bolas y varillas muestra los átomos como esferas de colores y los enlaces como varillas. Permite ver con facilidad los ángulos de enlace y la geometría molecular, por ejemplo el ángulo de 104,5° del agua o la forma tetraédrica del metano.
¿Qué diferencia hay entre los modelos de bolas y varillas y los compactos?
El modelo de bolas y varillas reduce los átomos para mostrar los enlaces y los ángulos. Un modelo compacto (CPK) dibuja cada átomo con su radio de van der Waals, así que muestra el tamaño y la forma reales de la molécula pero oculta los enlaces.
¿Qué significan los colores de un modelo molecular?
La mayoría de los modelos usan los colores CPK: el carbono es gris o negro, el hidrógeno blanco, el oxígeno rojo, el nitrógeno azul, el azufre amarillo, el cloro verde y el fósforo naranja.
¿Cómo veo una molécula en 3D?
Escribe su nombre en inglés (p. ej. caffeine), una cadena SMILES o un CID de PubChem y pulsa Mostrar modelo 3D. Arrastra para girar, pellizca para hacer zoom y cambia entre bolas y varillas, compacto, varillas y alambre.
¿De dónde salen las estructuras 3D?
De los confórmeros 3D calculados de PubChem. Algunas sales, complejos metálicos y moléculas muy grandes no tienen confórmero 3D, así que se muestra una representación 2D.
¿Puedo construir mi propia molécula?
Sí. Usa la herramienta Construye una molécula para unir átomos como en un kit, o dibuja cualquier estructura en el editor MolDraw y mírala en 3D.
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