Conversor de SMILES em estrutura 3D
Em resumo: Converta SMILES em uma estrutura 3D interativa. É gratuito, funciona no navegador e não precisa de download.
Cole uma string SMILES, gere uma estrutura 3D com o leve 3Dmol.js e baixe nos principais formatos de imagem e de estrutura.
Entrada SMILES
Estrutura 3D gerada
Formatos de entrada e saída
| Entrada: SMILES | Saída: estrutura 3D | |
|---|---|---|
| Nome completo | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | Estrutura 3D |
| O que contém | Átomos, ligações, anéis, cargas e estereoquímica em uma única linha de texto. Sem coordenadas. | Um modelo com coordenadas x, y, z para cada átomo, exibido em uma visualização que pode ser girada. |
| Arquivo ou forma | .smi ou texto simples | Na tela, com download de arquivos |
Formatos de arquivo explicados
SMILES é uma representação em texto compacta da conectividade molecular. É excelente para entrada, busca e bancos de dados, mas não armazena diretamente uma conformação 3D final.
Formatos de estrutura 3D como SDF, XYZ, PDB, MOL, OBJ e X3D armazenam coordenadas ou geometria renderizável. SDF e PDB são formatos químicos de coordenadas, XYZ é uma tabela simples de coordenadas atômicas, e OBJ/X3D são formatos de modelos 3D para visualização. Use o conversor de XYZ / Gaussian em 2D quando precisar transformar arquivos de coordenadas de volta em um desenho 2D inferido. Para prever a geometria VSEPR, os ângulos de ligação e a hibridização ao redor de um átomo central, experimente a calculadora de geometria molecular VSEPR.
As coordenadas 3D geradas são úteis para visualização e ensino. Para docking, química quântica ou geometria com qualidade de publicação, valide a protonação, a estereoquímica, a qualidade do confôrmero e a otimização por campo de força.
Precisa de uma figura para seu relatório? Desenhe estruturas químicas online com o MolDraw, uma alternativa online gratuita ao ChemDraw.
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