Convertidor de SMILES a estructura 3D
En resumen: convierte SMILES en una estructura 3D interactiva. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descarga.
Pega una cadena SMILES, genera una estructura 3D con el ligero 3Dmol.js y descárgala en los principales formatos de imagen y de estructura.
Entrada SMILES
Estructura 3D generada
Formatos de entrada y salida
| Entrada: SMILES | Salida: estructura 3D | |
|---|---|---|
| Nombre completo | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | Estructura 3D |
| Qué contiene | Átomos, enlaces, anillos, cargas y estereoquímica en una línea de texto. Sin coordenadas. | Un modelo con coordenadas x, y, z para cada átomo, mostrado como una vista giratoria. |
| Archivo o forma | .smi o texto plano | En pantalla, con descarga de archivos |
El formato de archivo explicado
SMILES es una representación textual compacta de la conectividad molecular. Es excelente para la entrada de datos, la búsqueda y las bases de datos, pero no almacena directamente una conformación 3D final.
Los formatos de estructura 3D, como SDF, XYZ, PDB, MOL, OBJ y X3D, almacenan coordenadas o geometría representable. SDF y PDB son formatos químicos de coordenadas, XYZ es una tabla sencilla de coordenadas atómicas y OBJ/X3D son formatos de modelos 3D para visualización. Usa el convertidor de XYZ / Gaussian a 2D cuando necesites convertir archivos de coordenadas de nuevo en un dibujo 2D deducido. Para predecir la forma VSEPR, los ángulos de enlace y la hibridación alrededor de un átomo central, prueba la calculadora de geometría molecular VSEPR.
Las coordenadas 3D generadas son útiles para visualización y docencia. Para docking, química cuántica o geometrías con calidad de publicación, valida la protonación, la estereoquímica, la calidad del confórmero y la optimización con campo de fuerzas.
¿Necesitas una figura para tu informe? Dibuja estructuras químicas en línea con MolDraw, una alternativa gratuita a ChemDraw en línea.
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