SDF 轉 InChI 工具

簡而言之:將 SDF 或 MOL 區塊轉換為標準 InChI 字串,用於索引與搜尋。完全免費,在網頁瀏覽器中執行,不需下載。

貼上 SDF 或 MOL 區塊,並將其轉換為標準 InChI 字串。

InChI 會顯示在這裡。

輸入與輸出格式

輸入:SDF輸出:InChI
全名SDF(結構資料檔)InChI(IUPAC 國際化學識別碼)
內容一筆或多筆 MOL 紀錄,各自可附帶資料欄位,以 $$$$ 分隔。由結構產生的分層文字識別碼。標準 InChI 在任何程式中都相同。
檔案或形式.sdf以 InChI=1S/ 開頭的文字

檔案格式說明

SDF 以 MOL 格式的原子與鍵區塊儲存分子紀錄,並可附加性質欄位,常用於化合物庫與篩選資料集。

InChI 是 IUPAC 制定的標準化識別碼,以分層文字形式表示分子。將 SDF 轉換為 InChI 有助於建立穩定的識別碼,用於搜尋、索引與去除重複。

若 SDF 含有多筆紀錄,請逐筆仔細轉換與檢查。鹽類結構、混合物、立體化學與缺少的氫原子都可能影響所得的 InChI。

關於 SDF 檔

SDF(structure-data file,結構資料檔)基本上是多筆 MOL 紀錄串接而成。每筆紀錄後面可接 > <NAME> 或 > <CAS> 等資料欄位,並以含有 $$$$ 的一行結束。化合物庫、PubChem 下載與供應商型錄常使用 SDF,因為一個檔案就能容納數千個分子及其性質。

為什麼要產生 InChI

標準 InChI 為每個結構提供與原子順序和畫法無關的標準識別碼,適用於合併化合物庫、去除重複,以及與公開資料庫比對化合物。

使用方式

  1. 用純文字編輯器開啟 .sdf 檔。
  2. 複製一筆紀錄(從標題列到 $$$$)並貼上。
  3. 轉換並複製 InChI,或用 InChI 轉 InChIKey 將其縮短。

疑難排解

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