CID 轉 SMILES 轉換器

重點摘要:將化合物 ID 解析為標準 SMILES 字串,供化學流程使用。免費、在網頁瀏覽器中執行,無需下載。

將 PubChem CID 值轉為標準 SMILES 識別碼。

SMILES 輸出會顯示在這裡。

輸入與輸出格式

輸入:PubChem CID輸出:SMILES
全名PubChem CIDSMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System)
內容PubChem 資料庫中某筆紀錄的化合物 ID,用於查詢取得結構。以一行文字表示原子、鍵、環、電荷與立體化學。不含座標。
檔案或形式整數,例如 2244.smi 或純文字

檔案格式說明

PubChem CID 是 PubChem 使用的數字化合物識別碼。它指向一筆資料庫紀錄,而不是直接編碼分子結構。

SMILES 是表示分子連接方式的精簡線性表示法。當資料庫提供 PubChem ID,而您的繪圖或化學資訊工具需要結構字串時,將 CID 轉為 SMILES 就很有用。

CID 查詢依賴 PubChem 紀錄。不同的化合物紀錄、鹽類、同位素或立體化學形式可能有不同的 CID 與 SMILES 字串。

關於 PubChem CID

PubChem 化合物 ID(CID)是 PubChem 為其資料庫中每個獨特化學結構指定的數字識別碼。例如阿斯匹靈為 CID 2244,咖啡因為 CID 2519。論文、供應商目錄與資料集常引用 CID,但光有數字無法得知結構。將其轉為 SMILES 即可得到可編輯的結構字串。

使用方式

  1. 輸入一個 CID(只輸入數字,不加「CID」字首)。
  2. 執行轉換,從 PubChem 取得標準 SMILES。
  3. 將 SMILES 複製到 MolDraw、試算表或其他轉換器。

常見問題

CID 與 CAS 號碼一樣嗎?不一樣。CAS 登記號由美國化學文摘社(Chemical Abstracts Service)指定,格式含連字號,例如 50-78-2;CID 是 PubChem 自己的流水號。為什麼鹽類會得到含點的 SMILES?鹽類與混合物含有分開的成分,SMILES 以點表示,例如 [Na+].[Cl-]。

下一步:使用 SMILES 轉結構繪製,或使用 SMILES 轉 InChIKey 取得識別碼。

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