SMILES 轉 SDF 工具
簡而言之：將 SMILES 字串轉換為 SDF 格式，用於篩選與資料集流程。完全免費，在網頁瀏覽器中執行，不需下載。
將 SMILES 轉換為 SDF，用於資料集與虛擬篩選流程。
SDF 輸出會顯示在這裡。
輸入與輸出格式
| 輸入：SMILES | 輸出：SDF | |
|---|---|---|
| 全名 | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | SDF（結構資料檔） |
| 內容 | 以一行文字表示原子、鍵、環、電荷與立體化學，不含座標。 | 一筆或多筆 MOL 紀錄，各自可附帶資料欄位，以 $$$$ 分隔。 |
| 檔案或形式 | .smi 或純文字 | .sdf |
檔案格式說明
SMILES 是表示分子連接方式的精簡字串，便於搜尋與交換，但通常不包含豐富的中繼資料。
SDF 是結構資料檔格式，可儲存一筆或多筆分子紀錄，通常包含 MOL 格式的原子/鍵區塊與可選的性質欄位。SDF 常用於篩選化合物庫、化合物資料集與化學資訊學流程。
需要能同時攜帶結構紀錄與化合物性質的檔案時，請使用 SDF。批次使用前請檢查立體化學與產生的座標。
為什麼使用 SDF
SDF（structure-data file，結構資料檔）儲存一個或多個結構，每個結構為一個 MOL 連接表，後接可選的具名資料欄位與 $$$$ 分隔符。它是在化學資訊學工具、化合物登錄系統與資料庫之間移轉化合物集的標準方式，因為 ID、名稱或試驗結果等性質可以隨每個結構一起傳遞。
使用方式
- 貼上 SMILES，例如乙醯胺酚
CC(=O)NC1=CC=C(C=C1)O。 - 轉換並下載 .sdf 檔。
- 在你的化學軟體中開啟，或將數個轉換後的檔案合併成一個化合物庫。
紀錄格式範例
- 標題列，接著是含原子數與鍵數的計數行。
- 原子區塊（座標與元素）與鍵區塊。
M END，接著是> <NAME>等資料欄位及其數值。- 以
$$$$結束該筆紀錄。
常見問題
SDF 與 MOL 有什麼不同？MOL 檔只包含一個結構；SDF 可包含多個結構與資料。可以轉回識別碼嗎？可以，請使用 SDF 轉 InChIKey 或 SDF 轉 InChI。
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