SDF 轉 InChIKey 工具
簡而言之:將 SDF 或 MOL 區塊轉換成標準 InChIKey 識別碼,方便資料庫比對。完全免費,在網頁瀏覽器中執行,不需下載。
貼上 SDF 或 MOL 區塊,轉換成標準 InChIKey。
InChIKey 會顯示在這裡。
輸入與輸出格式
| 輸入:SDF | 輸出:InChIKey | |
|---|---|---|
| 全名 | SDF(結構資料檔) | InChIKey |
| 內容 | 一筆或多筆 MOL 紀錄,各自可附帶資料欄位,以 $$$$ 分隔。 | 由 InChI 雜湊而成的 27 字元鍵值,專為網路與資料庫搜尋設計。若沒有查詢用資料庫,無法還原成結構。 |
| 檔案或形式 | .sdf | 形如 XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z 的文字 |
檔案格式說明
SDF 是一種結構資料格式,可儲存原子/鍵結區塊與化合物性質,廣泛用於化學資料集與篩選化合物庫。
InChIKey 是由 InChI 衍生的精簡雜湊識別碼,特別適合資料庫比對、建立索引,以及檢查兩筆紀錄是否可能為同一化合物。
InChIKey 方便搜尋,但無法完全還原。若之後還需要座標、原子區塊或性質欄位,請保留原始 SDF。
在化合物庫中使用 InChIKey
收到 SDF 格式的化合物庫時,為每筆紀錄產生 InChIKey,就能得到簡短、可搜尋的結構指紋。鍵值很容易放進試算表與資料庫,也方便找出以不同名稱或編號列出的同一化合物。
使用方式
- 複製一筆或多筆 SDF 紀錄,每筆以
$$$$結尾。 - 貼上並轉換。
- 將產生的 27 字元鍵值複製到試算表中,放在化合物編號旁。
實際用途
- 去除重複:依 InChIKey 排序;鍵值相同代表結構相同(包括立體化學)。
- 找出立體異構物:依前 14 字元區塊分組,即可找出骨架相同、但立體化學或同位素不同的化合物。
- 交叉比對:在公開資料庫中搜尋鍵值,查找文獻、供應商或安全資料。
注意:SDF 紀錄中的鹽類與混合物會以整筆紀錄產生鍵值,因此鹽酸鹽與其游離鹼的鍵值不同。若要比對母體化合物,請先移除相對離子。若需要完整識別碼,請使用 SDF 轉 InChI。
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