IUPAC 名稱轉 SMILES 工具
簡而言之:將系統名稱轉換成 SMILES,或依名稱/CID 從 PubChem 匯入化合物。完全免費,在網頁瀏覽器中執行,不需下載。
將 IUPAC 名稱或 PubChem 化合物名稱轉換成 SMILES,方便把文獻中的名稱變成結構字串。請輸入英文名稱。
SMILES 會顯示在這裡。
輸入與輸出格式
| 輸入:IUPAC 名稱 | 輸出:SMILES | |
|---|---|---|
| 全名 | IUPAC 名稱 | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| 內容 | 依 IUPAC 命名規則所訂的系統化學名稱。 | 以一行文字表示原子、鍵、環、電荷與立體化學,不含座標。 |
| 檔案或形式 | 文字 | .smi 或純文字 |
檔案格式說明
IUPAC 名稱是以系統方式描述結構的正式化學名稱,適用於論文與教學,但冗長的名稱不易貼入軟體流程中使用。
SMILES 是精簡的結構字串,廣泛用於繪圖工具、資料庫、化學資訊學程式與轉換工具。將 IUPAC 名稱轉成 SMILES,可把文獻名稱變成電腦可讀的結構。
名稱解析最適合明確且公認的名稱。鹽類、混合物、立體化學、俗名與拼寫差異,可能查無結果或對應到不同的紀錄。
名稱轉 SMILES 的使用技巧
系統性 IUPAC 名稱能精確描述結構,但名稱冗長又容易打錯。將名稱轉換成 SMILES,就能得到精簡、電腦可讀的結構,可貼到繪圖工具或試算表中。
範例
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid(阿斯匹靈)→
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid(L-丙胺酸)→
C[C@@H](C(=O)O)N
取得良好結果的方法
- 請完整照抄名稱,包括位次編號、逗號、連字號與括號:1,2-dichloroethane 與 1,1-dichloroethane 並不相同。
- 若需要特定的異構物,請加上 (R)、(S)、(E) 或 (Z) 等立體描述符;否則立體化學可能不會被指定。
- caffeine 等俗名通常也能使用,但非常新或罕見的商品名可能無法解析。
- 留意從 PDF 複製時夾帶的排版字元,例如特殊破折號或撇號,請改成一般的連字號與單引號。
要反向轉換嗎?請使用 SMILES 轉 IUPAC 名稱。
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