XYZ 轉 SMILES 工具
簡而言之:貼上或上傳 XYZ 座標檔,推斷化學鍵,將結構載入可編輯的 2D 畫布,並複製盡力推得的 SMILES。完全免費,在網頁瀏覽器中執行,不需下載。
貼上或上傳 XYZ 座標檔,推斷可能的化學鍵,將結果載入可編輯的 2D 畫布,並複製盡力推得的 SMILES 字串。
快速解答:XYZ 檔不儲存鍵級,因此本工具會先建立推斷的 MOL 檔,讓 MolDraw 編輯器整理 2D 版面,再從可編輯的結構讀取 SMILES。
輸入 XYZ 座標
就緒。請貼上 XYZ 座標並轉換。
輸入與輸出格式
| 輸入:XYZ 座標檔 | 輸出:SMILES | |
|---|---|---|
| 全名 | XYZ 座標檔 | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| 內容 | 只有元素符號與 x、y、z 座標。化學鍵沒有儲存,必須推算出來。 | 以一行文字表示原子、鍵、環、電荷與立體化學,不含座標。 |
| 檔案或形式 | .xyz | .smi 或純文字 |
XYZ 轉 SMILES 說明
XYZ 檔通常只儲存原子符號與 3D 座標,一般不包含鍵級、形式電荷、芳香性或立體化學。
請將本工具視為盡力而為的轉換工具。在資料庫、建模工具、出版品或作業中使用 SMILES 之前,請先在 2D 編輯器中檢查推斷的化學鍵。
- 產生 SMILES 前會隱藏與碳相連的氫原子,讓編輯器使用一般的隱含氫。
- 鍵級一律推斷為單鍵;必要時請手動修正雙鍵、芳香環、電荷與立體化學。
- 若想先取得可視化的可編輯結構,請使用 XYZ / Gaussian 轉 2D 結構工具。
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