Konverter SMILES ke Struktur 3D
Singkatnya: Ubah SMILES menjadi struktur 3D interaktif. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Tempel string SMILES, buat struktur 3D dengan 3Dmol.js yang ringan, dan unduh dalam format gambar dan struktur utama.
Masukan SMILES
Hasil Struktur 3D
Format masukan dan keluaran
| Masukan: SMILES | Keluaran: struktur 3D | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | Struktur 3D |
| Isi data | Atom, ikatan, cincin, muatan, dan stereo dalam satu baris teks. Tanpa koordinat. | Model dengan koordinat x, y, z untuk setiap atom, ditampilkan sebagai tampilan yang dapat diputar. |
| File atau bentuk | .smi atau teks biasa | Di layar, dengan unduhan file |
Penjelasan Format File
SMILES adalah representasi teks ringkas dari keterhubungan molekul. SMILES sangat baik untuk masukan, pencarian, dan alur kerja basis data, tetapi tidak menyimpan konformasi 3D akhir secara langsung.
Format struktur 3D seperti SDF, XYZ, PDB, MOL, OBJ, dan X3D menyimpan koordinat atau geometri yang dapat ditampilkan. SDF dan PDB adalah format koordinat kimia, XYZ adalah tabel koordinat atom sederhana, dan OBJ/X3D adalah format model 3D untuk alur kerja visualisasi. Gunakan konverter XYZ / Gaussian ke 2D bila Anda perlu mengubah file koordinat kembali menjadi gambar 2D hasil inferensi. Untuk memprediksi bentuk VSEPR, sudut ikatan, dan hibridisasi di sekitar atom pusat, coba kalkulator geometri molekul VSEPR.
Koordinat 3D yang dihasilkan berguna untuk visualisasi dan pengajaran. Untuk docking, kimia kuantum, atau geometri berkualitas publikasi, validasi protonasi, stereokimia, kualitas konformer, dan optimasi medan gaya.
Perlu gambar untuk laporan Anda? Gambar struktur kimia online dengan MolDraw, alternatif ChemDraw online yang gratis.
Terakhir diperbarui: