Conversor de SMILES em InChI
Em resumo: Converta strings SMILES em identificadores InChI padrão para bancos de dados e publicações. É gratuito, funciona no seu navegador e não precisa de download.
Converta SMILES em InChI padrão para busca, indexação e publicações.
Formatos de entrada e saída
| Entrada: SMILES | Saída: InChI | |
|---|---|---|
| Nome completo | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| O que contém | Átomos, ligações, anéis, cargas e estereoquímica em uma única linha de texto. Sem coordenadas. | Um identificador de texto em camadas gerado a partir da estrutura. O InChI padrão é o mesmo em qualquer programa. |
| Arquivo ou forma | .smi ou texto simples | Texto que começa com InChI=1S/ |
Formatos de arquivo explicados
SMILES é uma notação linear compacta para a conectividade molecular. É prática para ferramentas de desenho, caixas de busca e scripts.
InChI é o Identificador Químico Internacional da IUPAC. É um identificador padronizado, em camadas, criado para troca, indexação e comparação em bancos de dados químicos.
Use SMILES quando precisar de uma string de estrutura editável. Use InChI quando precisar de um identificador padronizado que dependa menos de um estilo específico de canonicalização de SMILES.
Exemplo e leitura da saída
O SMILES da aspirina CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O é convertido em:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: versão 1, InChI padrão.C9H8O4: a camada da fórmula molecular./c…: a camada de conectividade, com a numeração de átomos própria do InChI./h…: onde ficam os hidrogênios; os parênteses marcam um hidrogênio móvel compartilhado entre os dois oxigênios do ácido carboxílico.
Por que a mesma molécula sempre dá o mesmo InChI
Vários SMILES diferentes podem descrever a aspirina, dependendo do átomo pelo qual você começa. O InChI padrão é canônico, então todos produzem a string idêntica acima. Isso faz do InChI uma boa escolha para comparar estruturas e verificar duplicatas.
Perguntas frequentes
A estereoquímica é incluída? Sim. @ e @@ no SMILES viram camadas /t, /m e /s no InChI. Precisa de algo mais curto? Use SMILES para InChIKey.
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