Convertitore da SMILES a struttura 3D
In breve: converti uno SMILES in una struttura 3D interattiva. È gratuito, funziona nel browser e non richiede download.
Incolla una stringa SMILES, genera una struttura 3D con il leggero 3Dmol.js e scaricala nei principali formati di immagine e di struttura.
Input SMILES
Struttura 3D generata
Formati di input e output
| Input: SMILES | Output: struttura 3D | |
|---|---|---|
| Nome completo | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | Struttura 3D |
| Cosa contiene | Atomi, legami, anelli, cariche e stereochimica in una sola riga di testo. Nessuna coordinata. | Un modello con coordinate x, y, z per ogni atomo, mostrato in una vista ruotabile. |
| File o forma | .smi o testo semplice | A schermo, con download dei file |
Formati di file spiegati
Lo SMILES è una rappresentazione testuale compatta della connettività molecolare. È ottimo per input, ricerca e banche dati, ma non memorizza direttamente una conformazione 3D finale.
I formati di struttura 3D come SDF, XYZ, PDB, MOL, OBJ e X3D memorizzano coordinate o geometria visualizzabile. SDF e PDB sono formati chimici di coordinate, XYZ è una semplice tabella di coordinate atomiche e OBJ/X3D sono formati di modelli 3D per la visualizzazione. Usa il convertitore da XYZ / Gaussian a 2D quando devi trasformare file di coordinate in un disegno 2D dedotto. Per prevedere la geometria VSEPR, gli angoli di legame e l'ibridazione attorno a un atomo centrale, prova il calcolatore della geometria molecolare VSEPR.
Le coordinate 3D generate sono utili per visualizzazione e didattica. Per docking, chimica quantistica o geometrie di qualità da pubblicazione, verifica protonazione, stereochimica, qualità del conformero e ottimizzazione con campo di forza.
Ti serve una figura per la relazione? Disegna strutture chimiche online con MolDraw, un'alternativa online gratuita a ChemDraw.
Ultimo aggiornamento: