SMILES-in-3D-Struktur-Konverter
Kurz gesagt: Wandle SMILES in eine interaktive 3D-Struktur um. Es ist kostenlos, läuft im Webbrowser und braucht keinen Download.
Füge einen SMILES-String ein, erzeuge mit dem schlanken 3Dmol.js eine 3D-Struktur und lade sie in gängigen Bild- und Strukturformaten herunter.
SMILES-Eingabe
3D-Strukturausgabe
Eingabe- und Ausgabeformate
| Eingabe: SMILES | Ausgabe: 3D-Struktur | |
|---|---|---|
| Vollständiger Name | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | 3D-Struktur |
| Inhalt | Atome, Bindungen, Ringe, Ladungen und Stereochemie als eine Textzeile. Keine Koordinaten. | Ein Modell mit x-, y- und z-Koordinaten für jedes Atom, als drehbare Ansicht dargestellt. |
| Datei oder Form | .smi oder Klartext | Auf dem Bildschirm, mit Datei-Downloads |
Dateiformate erklärt
SMILES ist eine kompakte Textdarstellung der Konnektivität eines Moleküls. Es eignet sich hervorragend für Eingabe, Suche und Datenbanken, speichert aber keine endgültige 3D-Konformation.
3D-Strukturformate wie SDF, XYZ, PDB, MOL, OBJ und X3D speichern Koordinaten oder darstellbare Geometrie. SDF und PDB sind chemische Koordinatenformate, XYZ ist eine einfache Tabelle von Atomkoordinaten, und OBJ/X3D sind 3D-Modellformate für die Visualisierung. Verwende den XYZ/Gaussian-in-2D-Konverter, wenn du Koordinatendateien wieder in eine abgeleitete 2D-Zeichnung umwandeln möchtest. Um die VSEPR-Geometrie, Bindungswinkel und Hybridisierung um ein Zentralatom vorherzusagen, probiere den VSEPR-Molekülgeometrie-Rechner.
Erzeugte 3D-Koordinaten sind nützlich für Visualisierung und Lehre. Für Docking, Quantenchemie oder Geometrien in Publikationsqualität solltest du Protonierung, Stereochemie, Konformerqualität und Kraftfeldoptimierung prüfen.
Du brauchst eine Abbildung für deinen Bericht? Zeichne chemische Strukturen online mit MolDraw, einer kostenlosen Online-Alternative zu ChemDraw.
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