Convertisseur SMILES en MOL

En bref : convertissez des SMILES en fichiers de structure MOL pour une compatibilité maximale. Il est gratuit, fonctionne dans votre navigateur et ne nécessite aucun téléchargement.

Convertissez un SMILES au format MOL téléchargeable, compatible avec les éditeurs et les cahiers de laboratoire électroniques.

Le résultat MOL s'affiche ici.

Formats d'entrée et de sortie

	Entrée : SMILES	Sortie : fichier MOL
Nom complet	SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System)	Fichier MOL (MDL Molfile)
Contenu	Atomes, liaisons, cycles, charges et stéréochimie sur une seule ligne de texte. Pas de coordonnées.	Une liste d'atomes avec coordonnées 2D ou 3D et une table des liaisons pour une molécule.
Fichier ou forme	.smi ou texte brut	.mol

Les formats de fichier expliqués

SMILES est un identifiant textuel compact d'une molécule sur une seule ligne. Il se colle facilement dans des bases de données, scripts et outils web, mais ne stocke pas de disposition 2D dessinée.

MOL, aussi appelé molfile, stocke des tables d'atomes et de liaisons avec leurs coordonnées. Utilisez le MOL lorsqu'un éditeur, un cahier de laboratoire électronique ou un outil de chémoinformatique a besoin d'un fichier de structure modifiable plutôt que d'un identifiant textuel.

Après conversion, vérifiez la stéréochimie, les charges et les cycles aromatiques avant d'utiliser le fichier MOL pour une publication, un enregistrement ou un calcul.

Ce que contient un fichier MOL

Le SMILES indique quels atomes sont liés, mais ne contient aucune coordonnée. Un fichier MOL ajoute une disposition 2D : chaque atome reçoit des coordonnées x et y, si bien que d'autres logiciels peuvent afficher la molécule sans recalculer sa disposition. Le MOL est donc un choix sûr pour transférer une structure vers un logiciel compatible ChemDraw, un cahier de laboratoire électronique ou un système d'enregistrement.

Lire le résultat

Lignes 1 à 3 : en-tête (nom, logiciel, commentaire).
Ligne de comptage : nombre d'atomes et de liaisons, plus la mention de version V2000.
Bloc des atomes : une ligne par atome avec ses coordonnées x, y, z et son symbole d'élément.
Bloc des liaisons : paires de numéros d'atomes et type de liaison (1 simple, 2 double, 3 triple).
M END clôt l'enregistrement.

Mode d'emploi

Collez un SMILES comme CCO (éthanol).
Convertissez puis téléchargez ou copiez le texte MOL.
Enregistrez-le avec l'extension .mol et ouvrez-le dans le logiciel de votre choix.

Plusieurs molécules dans un seul fichier ? Utilisez SMILES en SDF. Besoin de coordonnées 3D pour la modélisation ? Essayez SMILES en PDB.

Dernière mise à jour : 11 octobre 2026