Convertisseur MOL en SMILES
En bref : collez un contenu MOL/SDF et convertissez-le en SMILES en ligne. Il est gratuit, fonctionne dans votre navigateur et ne nécessite aucun téléchargement.
Collez, importez ou récupérez depuis PubChem un bloc MOL/SDF, puis convertissez-le en SMILES. L'outil tente d'abord la conversion via PubChem, puis se rabat si possible sur NCI Cactus.
Collez un contenu MOL/SDF, importez un fichier ou récupérez une fiche SDF 2D depuis PubChem.
Formats d'entrée et de sortie
| Entrée : fichier MOL | Sortie : SMILES | |
|---|---|---|
| Nom complet | Fichier MOL (MDL Molfile) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Contenu | Une liste d'atomes avec coordonnées 2D ou 3D et une table des liaisons pour une molécule. | Atomes, liaisons, cycles, charges et stéréochimie sur une seule ligne de texte. Pas de coordonnées. |
| Fichier ou forme | .mol | .smi ou texte brut |
Les formats de fichier expliqués
Les fichiers MOL et SDF stockent des blocs d'atomes et de liaisons, souvent avec des coordonnées 2D ou 3D. Ils servent à échanger des structures modifiables et des fiches de données de composés.
SMILES traduit cette structure en une notation textuelle compacte sur une seule ligne. Elle est utile pour la recherche, les identifiants, les scripts et les outils web.
Lors d'une conversion MOL ou SDF en SMILES, vérifiez la stéréochimie, les charges, les sels et l'aromaticité. Certaines coordonnées ou propriétés du fichier source ne sont pas conservées dans le SMILES.
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