Convertisseur SMILES en InChI
En bref : convertissez des chaînes SMILES en identifiants InChI standard pour vos bases de données et publications. Il est gratuit, fonctionne dans votre navigateur et ne nécessite aucun téléchargement.
Convertissez un SMILES en InChI standard pour la recherche, l'indexation et la publication.
Formats d'entrée et de sortie
| Entrée : SMILES | Sortie : InChI | |
|---|---|---|
| Nom complet | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Contenu | Atomes, liaisons, cycles, charges et stéréochimie sur une seule ligne de texte. Pas de coordonnées. | Identifiant textuel en couches construit à partir de la structure. L'InChI standard est identique dans tous les logiciels. |
| Fichier ou forme | .smi ou texte brut | Texte commençant par InChI=1S/ |
Le format expliqué
Le SMILES est une notation linéaire compacte de la connectivité moléculaire. Elle est pratique pour les logiciels de dessin, les champs de recherche et les scripts.
L'InChI est l'identifiant chimique international de l'IUPAC (IUPAC International Chemical Identifier). C'est un identifiant normalisé en couches, conçu pour l'échange, l'indexation et la comparaison dans les bases de données chimiques.
Utilisez le SMILES lorsque vous avez besoin d'une chaîne de structure modifiable. Utilisez l'InChI lorsque vous avez besoin d'un identifiant normalisé, moins dépendant d'un style particulier de canonisation SMILES.
Exemple et lecture du résultat
Le SMILES de l'aspirine CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O se convertit en :
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: version 1, InChI standard.C9H8O4: la couche de la formule brute./c…: la couche de connectivité, avec la numérotation des atomes propre à l'InChI./h…: la position des hydrogènes ; les parenthèses signalent un hydrogène mobile partagé entre les deux oxygènes de l'acide carboxylique.
Pourquoi une même molécule donne toujours le même InChI
Plusieurs SMILES différents peuvent décrire l'aspirine, selon l'atome de départ. L'InChI standard est canonique : tous produisent la même chaîne ci-dessus. L'InChI est donc un bon choix pour comparer des structures et repérer des doublons.
FAQ
La stéréochimie est-elle incluse ? Oui. Les @ et @@ du SMILES deviennent les couches /t, /m et /s de l'InChI. Besoin de plus court ? Utilisez SMILES en InChIKey.
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