Convertidor de XYZ / Gaussian a estructura 2D

En resumen: pega o sube XYZ, Gaussian .gjf, .com o texto de coordenadas y genera un lienzo editable con la estructura molecular 2D y enlaces deducidos. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descarga.

Pega o sube XYZ, una entrada de Gaussian o texto de coordenadas cartesianas y genera un lienzo editable con la estructura 2D y enlaces deducidos.

Respuesta rápida: esta herramienta lee las coordenadas de los átomos, deduce los enlaces probables a partir de los radios covalentes, proyecta la geometría 3D en 2D, carga el resultado en el editor integrado y exporta SVG, PNG o un archivo MOL deducido.

Coordenadas de entrada

Listo. Pega las coordenadas y convierte.

Estructura 2D editable

Cargando el editor...
Vista previa SVG estática deducida
La vista previa de la estructura 2D aparece aquí.

Bloque MOL deducido

MOL output appears here.

El formato de archivo explicado

XYZ almacena los símbolos de los átomos y las coordenadas 3D, normalmente sin órdenes de enlace, cargas, aromaticidad ni estereoquímica. Es habitual en flujos de trabajo de química computacional y química cuántica.

Los archivos de entrada de Gaussian, como .gjf y .com, suelen contener una línea de carga/multiplicidad seguida de coordenadas cartesianas. Esta herramienta extrae esos bloques de coordenadas cuando es posible.

Como los archivos de coordenadas XYZ y Gaussian no suelen almacenar el orden de enlace, el resultado es una estructura 2D aproximada. Usa el lienzo 2D integrado para corregir los enlaces deducidos antes de una publicación, un docking o un análisis quimioinformático posterior.

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