Convertidor de SMILES a InChI
En resumen: convierte cadenas SMILES en identificadores InChI estándar para bases de datos y publicaciones. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descarga.
Convierte SMILES en InChI estándar para búsqueda, indexación y publicaciones.
Formatos de entrada y salida
| Entrada: SMILES | Salida: InChI | |
|---|---|---|
| Nombre completo | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Qué contiene | Átomos, enlaces, anillos, cargas y estereoquímica en una línea de texto. Sin coordenadas. | Un identificador de texto por capas generado a partir de la estructura. El InChI estándar es el mismo en todos los programas. |
| Archivo o forma | .smi o texto plano | Texto que empieza por InChI=1S/ |
El formato de archivo explicado
SMILES es una notación lineal compacta de la conectividad molecular. Es cómoda para herramientas de dibujo, cuadros de búsqueda y scripts.
InChI es el identificador químico internacional de la IUPAC. Es un identificador normalizado por capas, diseñado para el intercambio, la indexación y la comparación en bases de datos químicas.
Usa SMILES cuando necesites una cadena de estructura editable. Usa InChI cuando necesites un identificador normalizado que dependa menos de un estilo concreto de canonicalización de SMILES.
Ejemplo y lectura del resultado
El SMILES de la aspirina, CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O, se convierte en:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: versión 1, InChI estándar.C9H8O4: la capa de la fórmula molecular./c…: la capa de conectividad, con la numeración de átomos propia del InChI./h…: dónde están los hidrógenos; los paréntesis indican un hidrógeno móvil compartido entre los dos oxígenos del ácido carboxílico.
Por qué la misma molécula siempre da el mismo InChI
Varios SMILES distintos pueden describir la aspirina, según el átomo por el que empieces. El InChI estándar es canónico, así que todos producen la misma cadena de arriba. Esto hace del InChI una buena opción para comparar estructuras y detectar duplicados.
Preguntas frecuentes
¿Incluye la estereoquímica? Sí. Los @ y @@ del SMILES se convierten en las capas /t, /m y /s del InChI. ¿Necesitas algo más corto? Usa SMILES a InChIKey.
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