SMILES-in-InChI-Konverter
Kurz gesagt: Wandle SMILES-Strings in Standard-InChI-Kennungen für Datenbanken und Publikationen um. Er ist kostenlos, läuft im Webbrowser und braucht keinen Download.
Wandle SMILES in Standard-InChI für Suche, Indexierung und Publikationen um.
Eingabe- und Ausgabeformate
| Eingabe: SMILES | Ausgabe: InChI | |
|---|---|---|
| Vollständiger Name | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Inhalt | Atome, Bindungen, Ringe, Ladungen und Stereochemie als eine Textzeile. Keine Koordinaten. | Eine schichtweise aufgebaute Textkennung, die aus der Struktur erzeugt wird. Der Standard-InChI ist in jedem Programm gleich. |
| Datei oder Form | .smi oder Klartext | Text, der mit InChI=1S/ beginnt |
Dateiformate erklärt
SMILES ist eine kompakte Liniennotation für die Konnektivität von Molekülen. Sie ist praktisch für Zeichenprogramme, Suchfelder und Skripte.
InChI ist der IUPAC International Chemical Identifier. Er ist eine schichtweise aufgebaute, standardisierte Kennung für den Austausch, die Indexierung und den Vergleich in chemischen Datenbanken.
Verwende SMILES, wenn du einen bearbeitbaren Struktur-String brauchst. Verwende InChI, wenn du eine standardisierte Kennung brauchst, die weniger von einem bestimmten SMILES-Kanonisierungsstil abhängt.
Beispiel und Lesen der Ausgabe
Der SMILES von Aspirin, CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O, wird umgewandelt in:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: Version 1, Standard-InChI.C9H8O4: die Schicht der Summenformel./c…: die Konnektivitätsschicht mit der InChI-eigenen Atomnummerierung./h…: wo die Wasserstoffatome sitzen; die Klammern kennzeichnen ein mobiles Wasserstoffatom, das sich die beiden Sauerstoffatome der Carbonsäure teilen.
Warum dasselbe Molekül immer denselben InChI ergibt
Je nachdem, bei welchem Atom man beginnt, können verschiedene SMILES Aspirin beschreiben. Der Standard-InChI ist kanonisch, daher liefern alle denselben String wie oben. Das macht InChI zu einer guten Wahl, um Strukturen zu vergleichen und Duplikate zu prüfen.
FAQ
Ist die Stereochemie enthalten? Ja. @ und @@ im SMILES werden im InChI zu den Schichten /t, /m und /s. Brauchst du etwas Kürzeres? Verwende SMILES in InChIKey.
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