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R/S 手性判断工具(CIP 规则,逐步讲解)

简而言之:绘制分子或粘贴其 SMILES。工具会标出每个立体中心,标记 R 或 S,并展示每个 CIP 优先级是如何确定的。双键会标为 E 或 Z。

可用于检查作业、学习 Cahn–Ingold–Prelog 规则,或在为报告绘制药物结构前先标注构型。没有画楔形键或虚线键的中心会被标为未定义。

快速解答:L-丙氨酸 N[C@@H](C)C(=O)O 有一个立体中心:NH₂ (1) > COOH (2) > CH₃ (3) > H (4),H 朝后时 1 → 2 → 3 为逆时针,因此为 (S)。

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示例:

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如何使用 R/S 判断工具

  1. 在编辑器中绘制分子,在每个立体中心使用楔形键(朝向你)和虚线键(远离你),或粘贴带有 @/@@ 和 / \ 标记的 SMILES 字符串。
  2. 右侧的图会为每个中心标注 R、S 或 (?),并为每个立体双键标注 E 或 Z。
  3. 每个立体中心都有一张卡片,列出编号为 1–4 的四个基团以及确定每个优先级的比较过程。
  4. 点击在 MolDraw 中打开可保留结构、添加标注并导出。

CIP 优先级规则(Cahn–Ingold–Prelog)

  1. 原子序数大者优先。观察与立体中心相连的四个原子:I > Br > Cl > S > F > O > N > C > H。
  2. 同位素:如果两个原子是同种元素,质量较大的同位素优先(D > H)。
  3. 相同时向外推进一层。列出每个相同原子所连的三个原子(从高到低),例如 CH₂OH = {O, H, H},CH(CH₃)₂ = {C, C, H}。在第一个不同处比较:{O, H, H} 优于 {C, C, H},因为 O 优于 C。如果仍然相同,再向外推进一个键,始终先沿优先级较高的分支。
  4. 双键和三键分别按两个或三个单键计:在 C=O 中,碳获得一个复制的 O,O 获得一个复制的 C。因此 –CHO = {O, O, H},优于 –CH₂OH = {O, H, H}。
  5. 确定 R 或 S。使基团 4 远离你,沿 1 → 2 → 3 描画。顺时针 = R(rectus,右),逆时针 = S(sinister,左)。
捷径:如果优先级最低的基团在楔形键上(朝向你),就按图中所示描画 1 → 2 → 3,然后把答案反过来。

双键的 E/Z 构型

用相同规则对 C=C 每个碳上的两个基团排序。如果两个优先级较高的基团在同侧,则为 Z(zusammen,同侧);如果在异侧,则为 E(entgegen,异侧)。当优先级较高的基团不是较大的烷基链时,E/Z 可能与顺/反不一致。

有多少个立体异构体?

含有 n 个立体中心和立体双键的分子最多有 2n 个立体异构体。内消旋化合物(如内消旋酒石酸)具有内部对称面,因此实际数目更少:酒石酸有 3 个立体异构体,而不是 4 个。

例题

2-丁醇

基团:OH、CH₂CH₃、CH₃、H。OH 排第一 (O)。乙基在第 2 层优于甲基:{C, H, H} > {H, H, H}。

C[C@@H](O)CC 是 (R)-2-丁醇。

甘油醛

OH (O) > CHO {O, O, H} > CH₂OH {O, H, H} > H。C=O 中复制的 O 打破了平局。

D-甘油醛为 (R)。

半胱氨酸

CH₂SH {S, H, H} 优于 COOH {O, O, O},因为 S (16) > O (8),所以 L-半胱氨酸为 (R),而大多数 L-氨基酸为 (S)。

L-半胱氨酸 = (R)。

常见错误

本工具应用原子序数和同位素规则(规则 1 和 2)及复制原子。需要基于立体的规则 3–5 的少见情况(例如假不对称中心)会报告为平局。

规范地画出来。在免费的 MolDraw 编辑器中打开结构,添加楔形键、箭头和标注,然后导出 PNG 或 SVG 用于笔记和幻灯片。

打开完整的 MolDraw 编辑器

常见问题

如何确定 R 或 S 构型?

按原子序数(CIP 规则)对立体中心上的四个基团排序,使优先级最低的基团远离你,然后沿 1 → 2 → 3 描画。顺时针为 R,逆时针为 S。

什么是立体中心(手性中心)?

连有四个不同基团的原子,通常是 sp³ 碳。交换任意两个基团就得到另一个对映异构体。

两个碳基团相同时如何比较?

列出每个碳上所连的三个原子(从高到低),在第一个不同处进行比较。如果完全相同,则沿优先级较高的分支再向外推进一个键。

CIP 规则中双键如何处理?

双键按两个单键计:每个原子各获得对方原子的一个复制。因此 –CH=O 视为 C 连有 O、O 和 H。

为什么我的中心显示为未定义?

绘图中该中心没有楔形键或虚线键,因此既可能是 R 也可能是 S。请在编辑器中添加楔形键或虚线键,或在 SMILES 中使用 @ / @@。

E/Z 与顺/反有什么区别?

顺/反比较的是两个碳上的相同基团。E/Z 按 CIP 规则比较优先级较高的基团,因此适用于所有双键,包括连有四个不同基团的双键。

R/S 判断工具免费吗?

免费。它在浏览器中运行,无需注册。

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