SDF 转 InChIKey 转换器
简而言之:把 SDF 或 MOL 结构块转换为标准 InChIKey 标识符,用于数据库匹配。免费,在网页浏览器中运行,无需下载。
粘贴 SDF 或 MOL 结构块,将其转换为标准 InChIKey。
InChIKey 将显示在这里。
输入和输出格式
| 输入:SDF | 输出:InChIKey | |
|---|---|---|
| 全称 | SDF (Structure Data File) | InChIKey |
| 包含内容 | 一条或多条 MOL 记录,每条可带数据字段,以 $$$$ 分隔。 | InChI 的 27 位字符哈希值,专为网络和数据库检索设计。没有查询数据库就无法还原为结构。 |
| 文件或形式 | .sdf | 形如 XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z 的文本 |
文件格式说明
SDF 是一种结构-数据格式,可以存储原子/键块和化合物性质,广泛用于化学数据集和筛选化合物库。
InChIKey 是由 InChI 派生的简洁哈希标识符,特别适用于数据库匹配、索引,以及判断两条记录是否可能描述同一化合物。
InChIKey 便于检索,但不能完全还原。如果以后还需要坐标、原子块或性质字段,请保留原始 SDF。
在化合物库中使用 InChIKey
当你收到 SDF 格式的化合物库时,为每条记录生成 InChIKey,就得到一个简短、可检索的结构指纹。这些键很适合放入电子表格和数据库,便于发现以不同名称或编号列出的同一化合物。
使用方法
- 复制一条或多条 SDF 记录,每条以
$$$$结尾。 - 粘贴并转换。
- 把得到的 27 位字符键复制到电子表格中,放在化合物编号旁边。
实际用途
- 去重:按 InChIKey 排序;相同的键表示结构相同(包括立体化学)。
- 查找立体异构体:按前 14 位字符块分组,可收集骨架相同但立体构型或同位素不同的化合物。
- 交叉检索:在公共数据库中搜索这些键,查找文献、供应商或安全数据。
注意:SDF 记录中的盐和混合物会针对整条记录生成键,因此盐酸盐与其游离碱的键不同。如果要匹配母体化合物,请先去除抗衡离子。如需完整标识符,请使用 SDF 转 InChI。
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