MOL 转 InChI 转换器

简而言之:把 MOL 或 SDF 结构块转换为标准 InChI 标识符,用于化学数据处理。免费,在网页浏览器中运行,无需下载。

粘贴 MOL 或 SDF 结构块,将其转换为标准 InChI 标识符。

InChI 将显示在这里。

输入和输出格式

输入:MOL 文件输出:InChI
全称MOL 文件(MDL Molfile)InChI (IUPAC International Chemical Identifier)
包含内容一个分子的原子列表(含 2D 或 3D 坐标)和键表。由结构生成的分层文本标识符。标准 InChI 在任何软件中都相同。
文件或形式.mol以 InChI=1S/ 开头的文本

文件格式说明

MOL 以原子表和键表存储分子,通常带有 2D 或 3D 坐标,适合交换可编辑的结构。

InChI 是由结构生成的标准化文本标识符,适用于检索、索引、登记以及跨数据库比较化学记录。

转换质量取决于 MOL 文件中原子、键、电荷和立体化学是否清晰。请检查生成的 InChI 中盐、互变异构体和立体化学层的信息。

关于 MOL 文件

MOL 文件(MDL Molfile)以连接表形式存储单个结构:标题、计数行、包含 x、y、z 坐标和元素符号的原子块,以及列出哪些原子相连及键级的键块。大多数化学软件都能导出 MOL,因此它是一种常用的交换格式。它有两个版本:经典的固定列格式 V2000,以及支持更大分子和更多功能的 V3000。

为什么要转换为 InChI

InChI 提供一个与原子顺序和绘图坐标无关的标准标识符。同一分子以不同方式绘制的两个 MOL 文件会生成相同的标准 InChI,便于查重或检索数据库。

使用方法

  1. 用文本编辑器打开 .mol 文件并复制全部内容,包括标题行和最后的 M END 行。
  2. 粘贴到输入框中并转换。
  3. 复制 InChI,或用 InChI 转 InChIKey 进一步缩短。

故障排除:MOL 文件对列位置敏感,经文字处理软件重新排版的文件可能会失败。请从纯文本编辑器中复制。

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